Doutoramento em Engenharia Agronómica

Plano Curricular DEA 2008-2009

Biologia Computacional (BioComp)

Áreas Científicas - Matemática (M)

Contextos

Objectivos

Desenvolver e aprofundar conhecimentos na área da Informática – algoritmos e métodos necessários para a análise e processamento de informação biológica e molecular.

Programa

MÓDULO 1: Algoritmia e programação com R.

MÓDULO 2: Análise de “Big data”
Análise Transcritómica: microarrays e RNA-seq Ontologias e Vias KEGG

MÓDULO 3: Algoritmos e métodos computacionais para análise de dados biológicos.
- Optimização
- Grafos
- Algoritmos de sequenciação; alinhamento de sequências; pesquisa de motivos
- Análise em componentes principais
- Clustering
- Biclustering.

MÓDULO 4: Métodos de inferência estatística para dados biológicos.

MÓDULO 5: Hands on - Pretende-se que os alunos desenvolvam um trabalho onde
demonstrem capacidade para tratar, analisar e interpretar dados no contexto do seu
programa doutoral, recorrendo aos conteúdos e métodos computacionais abordados nos
módulos anteriores.

Metodologia de avaliação

Avaliação Contínua: 2 testes, 3 relatórios.
Em alternativa, 1 exame final.

Nível

2º Ciclo (M)

Regime

Semestral

Carga Horária

Aula Teórica (T): 0.0 h/semestre

Aula de Problemas (TP): 70.0 h/semestre

Orientação Tutorial (OT): 14.0 h/semestre

Trabalho Autónomo: 84.0 h/semestre

Créditos ECTS: 6.0