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BioMol/2015-2016/1-semestre
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Sumários
Biologia Molecular (1 º Sem 2015/2016)Sumários17/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Regulação da expressão génicaNíveis a que a expressão génica é regulada. Regulação positiva e negativa. Regulação da iniciação da transcrição em procariotas. Regulção negativa e positiva do operão lac em E. coli.
Modificado em
22/12/2015 09:49
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17/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Regulação da expressão génicaNíveis a que a expressão génica é regulada. Regulação positiva e negativa. Regulação da iniciação da transcrição em procariotas. Regulção negativa e positiva do operão lac em E. coli.
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22/12/2015 09:49
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15/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinanteDetecção e isolamento de moléculas específicas de DNA, RNA ou Proteina em misturas complexas. Southern, Northern e Western blotting. Clonagem. Bibliotecas genómicas e de cDNA. Polymerase Chain Reaction.
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22/12/2015 09:47
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15/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinanteDetecção e isolamento de moléculas específicas de DNA, RNA ou Proteina em misturas complexas. Southern, Northern e Western blotting. Clonagem. Bibliotecas genómicas e de cDNA. Polymerase Chain Reaction.
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22/12/2015 09:47
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10/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas TesteTeste
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22/12/2015 09:44
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10/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas TesteTeste
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22/12/2015 09:44
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08/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas FeriadoFeriado.
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09/12/2015 14:42
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08/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas FeriadoFeriado.
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03/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Marcação de moléculas de DNA. Random priming ou marcação de extremidades. Utilização na construção de mapas de restrição. Digestão parcial. Sequenciação de DNA. Métodos químico e enzimático.
Modificado em
09/12/2015 14:41
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03/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Marcação de moléculas de DNA. Random priming ou marcação de extremidades. Utilização na construção de mapas de restrição. Digestão parcial. Sequenciação de DNA. Métodos químico e enzimático.
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09/12/2015 14:41
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01/12/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Enzimas de restrição. Métodos para separação de moléculas de DNA. Mapas de restrição.
Modificado em
09/12/2015 14:39
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01/12/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Enzimas de restrição. Métodos para separação de moléculas de DNA. Mapas de restrição.
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26/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre recombinação.
Modificado em
09/12/2015 14:34
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26/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre recombinação.
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09/12/2015 14:34
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24/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Transposões
Retrotransposões e sua relação com retrovirus. Transposões de DNA. Transposição conservativa e transposição replicativa. Relação com recombinação específica. Consequências da transposição.
Modificado em
09/12/2015 14:32
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24/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Transposões
Retrotransposões e sua relação com retrovirus. Transposões de DNA. Transposição conservativa e transposição replicativa. Relação com recombinação específica. Consequências da transposição.
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09/12/2015 14:32
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19/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas VirusCiclos de infecção. Virus de DNA e de RNA. Mecanismos de replicação em virus de DNA. Replicação em virus de RNA via replicase ou transcritase reversa. Integração de genomas virais em cromossomas hospedeiros via recombinação específica. Ciclo lítico e lisogénico em lambda.
Modificado em
09/12/2015 14:29
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19/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas VirusCiclos de infecção. Virus de DNA e de RNA. Mecanismos de replicação em virus de DNA. Replicação em virus de RNA via replicase ou transcritase reversa. Integração de genomas virais em cromossomas hospedeiros via recombinação específica. Ciclo lítico e lisogénico em lambda.
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17/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Mecanismos de recombinação específica (site –specific recombination). Recombinases e locais de recombinação específica. Consequências da recombinação específica: Integração de moléculas de DNA, inversões e delecções.
Modificado em
09/12/2015 14:25
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17/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Mecanismos de recombinação específica (site –specific recombination). Recombinases e locais de recombinação específica. Consequências da recombinação específica: Integração de moléculas de DNA, inversões e delecções.
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12/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Aspectos gerais sobre recombinação. Recombinação homóloga vs. recombinação específica. Modelos de recombinação homóloga. Modelo de Holiday. Modelo Double Stran Break (DSB) e via recBCD em E. coli. Consequências da recombinação: crossing-over e patch-recombination.
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09/12/2015 14:23
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12/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Aspectos gerais sobre recombinação. Recombinação homóloga vs. recombinação específica. Modelos de recombinação homóloga. Modelo de Holiday. Modelo Double Stran Break (DSB) e via recBCD em E. coli. Consequências da recombinação: crossing-over e patch-recombination.
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10/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre reparação e replicação do DNA.
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09/12/2015 14:33
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10/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre reparação e replicação do DNA.
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09/12/2015 14:33
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05/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNAMismatch repair em procariotas e eucariotas. Problema da replicação das extremidades 3'. Telomerase.
Modificado em
09/12/2015 14:18
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05/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNAMismatch repair em procariotas e eucariotas. Problema da replicação das extremidades 3'. Telomerase.
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09/12/2015 14:18
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03/11/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNAIniciação e criação de forquilhas de replicação. Assimetria na forquilha: Cadeia leading e cadeia lagging. Fragmentos de Okasaki. Factores: Helicase, Primase (primossoma), topoisomerases, RNAse H, Sliding clamp. Coordenação da sintese contínua e descontínua na forquilha.
Modificado em
09/12/2015 14:16
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03/11/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNAIniciação e criação de forquilhas de replicação. Assimetria na forquilha: Cadeia leading e cadeia lagging. Fragmentos de Okasaki. Factores: Helicase, Primase (primossoma), topoisomerases, RNAse H, Sliding clamp. Coordenação da sintese contínua e descontínua na forquilha.
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29/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Revisões e testerevisões e teste
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09/12/2015 14:10
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29/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Revisões e testerevisões e teste
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09/12/2015 14:10
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27/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Carácter semi-conservativo da replicação do DNA. DNA polimerase: actividades de sintese e de auto-correcção. Junção primer/molde. Relação entre actividade de auto-correcção, direcção de sintese de DNA e incapacidade de iniciação. .
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09/12/2015 14:09
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27/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Carácter semi-conservativo da replicação do DNA. DNA polimerase: actividades de sintese e de auto-correcção. Junção primer/molde. Relação entre actividade de auto-correcção, direcção de sintese de DNA e incapacidade de iniciação. .
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09/12/2015 14:09
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22/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Reparação de DNA
Reparação de danos no DNA. Diferença entre danos e erros. Consequências. Tipos de danos: despurinação, desaminação espontânea da citosina e formação de dímeros de pirimidina. Reparação de danos por excisão de base e por excisão de nucleótidos.
Modificado em
09/12/2015 13:58
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22/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Reparação de DNA
Reparação de danos no DNA. Diferença entre danos e erros. Consequências. Tipos de danos: despurinação, desaminação espontânea da citosina e formação de dímeros de pirimidina. Reparação de danos por excisão de base e por excisão de nucleótidos.
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09/12/2015 13:58
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20/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre expressão génica (transcrição e tradução)
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09/12/2015 13:50
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20/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre expressão génica (transcrição e tradução)
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09/12/2015 13:50
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15/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Iniciação da tradução
Montagem do ribossoma em registo com o codão de iniciação no mRNA. Importância na determinação do quadro de leitura. Mutações frameshift. Diferenças na iniciação da tradução em procariotas e eucariotas e sua relação com a estrutura de mRNAs. Factores envolvidos. Efeitos de antibióticos na iniciação ou alongamento.
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09/12/2015 13:49
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15/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Iniciação da tradução
Montagem do ribossoma em registo com o codão de iniciação no mRNA. Importância na determinação do quadro de leitura. Mutações frameshift. Diferenças na iniciação da tradução em procariotas e eucariotas e sua relação com a estrutura de mRNAs. Factores envolvidos. Efeitos de antibióticos na iniciação ou alongamento.
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13/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Tradução
Estrutura de tRNAs. Ribossomas. Papel central de aminoacil-tRNA sintetases na tradução. Peptidil e aminoacil-tRNA. Código genético. Alongamento: ciclo em três passos: Selecção de aa-tRNA (emparelhamento codão/anticodão), ligação peptídica e translocação do ribossoma. Factores envolvidos. Mecanismos de terminação.
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09/12/2015 14:05
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13/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Estrutura de tRNAs. Ribossomas. Papel central de aminoacil-tRNA sintetases na tradução. Peptidil e aminoacil-tRNA. Código genético. Alongamento: ciclo em três passos: Selecção de aa-tRNA (emparelhamento codão/anticodão), ligação peptídica e translocação do ribossoma. Factores envolvidos. Mecanismos de terminação.
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09/12/2015 14:06
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08/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Splicing
Splicing pelo “Spliceossoma”.Estrutura de intrões. Estrutura do "spliceossoma". snRNPs. Mecanismo de splicing. Splicing alternativo.
Modificado em
23/10/2015 10:31
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08/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Splicing
Splicing pelo “Spliceossoma”.Estrutura de intrões. Estrutura do "spliceossoma". snRNPs. Mecanismo de splicing. Splicing alternativo.
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23/10/2015 10:31
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06/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Terminação da transcrição
Terminação da transcrição. Terminação dependente de rho ou independente de rho em procariotas. Poliadenilação e terminação da transcrição em eucariotas.
Modificado em
23/10/2015 10:29
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06/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Terminação da transcrição
Terminação da transcrição. Terminação dependente de rho ou independente de rho em procariotas. Poliadenilação e terminação da transcrição em eucariotas.
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23/10/2015 10:29
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01/10/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Alongamento e iniciação da transcrição
Ciclo de transcrição: Iniciação, alongamento e terminação. Funções múltiplas da RNA polimerase no alongamento. Iniciação: estrutura e papel de promotores na escolha do local de iniciação e da cadeia a ser transcrita.
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23/10/2015 10:28
Presenças:
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01/10/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Alongamento e terminação da transcrição
Ciclo de transcrição: Iniciação, alongamento e terminação. Funções múltiplas da RNA polimerase no alongamento. Iniciação: papel de promotores na escolha do local de iniciação e da cadeia a ser transcrita.
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23/10/2015 10:27
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29/09/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Expressão génica: Transcrição
Expressão génica: Transcrição (Síntese de RNA). Estrutura da RNA polimerase procariótica. Múltiplas RNA polimerases eucarióticas. Reacção central catalisada pela RNA polimerase: Adição de nucleótidos a extremidades livres 3’-OH. Paralelo com adição de nucleótidos pela DNA polimerase. Cópia usando molde. Polaridade na síntese de RNA (ou DNA).
Modificado em
23/10/2015 10:26
Presenças:
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29/09/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Expressão génica: Transcrição
Expressão génica: Transcrição (Síntese de RNA). Estrutura da RNA polimerase procariótica. Múltiplas RNA polimerases eucarióticas. Reacção central catalisada pela RNA polimerase: Adição de nucleótidos a extremidades livres 3’-OH. Paralelo com adição de nucleótidos pela DNA polimerase. Cópia usando molde. Polaridade na síntese de RNA (ou DNA).
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24/09/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura dos ácidos nucleicos. Bases azotadas, pentoses e grupos fosfato. Ligação N-glicosídica (base-pentose), ligação éster (pentose-fosfato). Nucleósidos e nucleótidos (nucleósidos monofosfato). Nucleósidos di e tri fosfato. Nomenclatura. Polaridade 5’-3’ de nucleótidos. Ligação fosfo-diéster (entre nucleótidos). Polaridade 5’-3’ de cadeias polinucleotídicas. Complementaridade de bases: Interacções por pontes de hidrogénio A-T e C-G (especificidade no emparelhamento). A hélice dupla de DNA: Duas cadeias complementares anti-paralelas. Propriedades da hélice: distância entre pares de bases, passo, diâmetro.
Modificado em
23/10/2015 10:24
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24/09/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura dos ácidos nucleicos. Bases azotadas, pentoses e grupos fosfato. Ligação N-glicosídica (base-pentose), ligação éster (pentose-fosfato). Nucleósidos e nucleótidos (nucleósidos monofosfato). Nucleósidos di e tri fosfato. Nomenclatura. Polaridade 5’-3’ de nucleótidos. Ligação fosfo-diéster (entre nucleótidos). Polaridade 5’-3’ de cadeias polinucleotídicas. Complementaridade de bases: Interacções por pontes de hidrogénio A-T e C-G (especificidade no emparelhamento). A hélice dupla de DNA: Duas cadeias complementares anti-paralelas. Propriedades da hélice: distância entre pares de bases, passo, diâmetro.
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23/10/2015 10:24
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22/09/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Estrutura e função de proteinas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos: Estrutura geral e classificação (acídicos, básicos, polares não carregados e apolares). A ligação peptídica. Níveis de estrutura de proteínas: Estrutura primária (sequência de aminoácidos). Ligações não covalentes (ex: pontes de hidrogénio) entre aminoácidos da mesma cadeia polipeptídica e estruturas secundárias (hélice alfa e folha beta). Interacções entre elementos de estrutura secundária implicam estrutura terciária. Estrutura quaternária resulta de interacções entre cadeias polipeptidicas. Importância das interacções fracas no estabelecimento da estrutura 3D de proteínas. Função depende de estrutura 3D. Estrutura 3D depende em última instância de estrutura primária.
Modificado em
23/10/2015 10:23
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22/09/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura e função de proteinas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos: Estrutura geral e classificação (acídicos, básicos, polares não carregados e apolares). A ligação peptídica. Níveis de estrutura de proteínas: Estrutura primária (sequência de aminoácidos). Ligações não covalentes (ex: pontes de hidrogénio) entre aminoácidos da mesma cadeia polipeptídica e estruturas secundárias (hélice alfa e folha beta). Interacções entre elementos de estrutura secundária implicam estrutura terciária. Estrutura quaternária resulta de interacções entre cadeias polipeptidicas. Importância das interacções fracas no estabelecimento da estrutura 3D de proteínas. Função depende de estrutura 3D. Estrutura 3D depende em última instância de estrutura primária.
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23/10/2015 10:23
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17/09/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Pequenas moléculas biológicas
Pequenas moléculas biológicas. Água, ligações covalentes e ligações de hidrogénio. Moléculas hidrofílicas e hidrofóbicas. Ácido/base. Esqueletos de carbono. Tipos frequentes de combinações de átomos: Metil, hidroxil, carboxil, amino. Commpostos com C e O: Alcool, aldeído, cetona e éster. Compostos com C e N: aminas e amidas. Fosfatos: Fosfato inorgânico, éster de fosfato e ácido anídrico. Principais pequenas moléculas biológicas: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.
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23/10/2015 10:21
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17/09/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Pequenas moléculas biológicas
Pequenas moléculas biológicas. Água, ligações covalentes e ligações de hidrogénio. Moléculas hidrofílicas e hidrofóbicas. Ácido/base. Esqueletos de carbono. Tipos frequentes de combinações de átomos: Metil, hidroxil, carboxil, amino. Commpostos com C e O: Alcool, aldeído, cetona e éster. Compostos com C e N: aminas e amidas. Fosfatos: Fosfato inorgânico, éster de fosfato e ácido anídrico. Principais pequenas moléculas biológicas: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.
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23/10/2015 10:21
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15/09/2015 11:00 Aula Teórico-Práticas Apresentação
Apresentações. Regras de funcionamento: Assiduidade, avaliação (dois testes intercalares e exame final com pesos de 30% e 70% respectivamente). Elementos de estudo: Bibliografia principal: Livros de texto Molecular Biology of the Gene (MBG) e Molecular Biology of the Cell (MBC), animações em MBG, fichas de problemas. Visão geral do programa.
Modificado em
23/10/2015 10:20
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15/09/2015 08:15 Aula Teórico-Práticas Apresentação
Apresentações. Regras de funcionamento: Assiduidade, avaliação (dois testes intercalares e exame final com pesos de 30% e 70% respectivamente). Elementos de estudo: Bibliografia principal: Livros de texto Molecular Biology of the Gene (MBG) e Molecular Biology of the Cell (MBC), animações em MBG, fichas de problemas. Visão geral do programa.
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23/10/2015 10:20
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