Programa

Bioinformática

Licenciatura Bolonha em Biologia

Programa

Introdução à Bioinformática: levantamento dos problemas; Principais marcos na história da Biologia Molecular e na Bioinformática Genomas e organização da informação; Sequenciação de DNA: - métodos clássicos (de Maxam & Gilbert e de Sanger) e métodos de alto rendimento (pirosequenciação) - Análise crítica de outputs de sequenciação Sequenciação de genomas: estratégias utilizadas e problemas associados à dimensão dos genomas e composição da molécula de DNA Plataformas e Bases de dados de interesse biológico: - NCBI – entrez; EMBL; Swiss-Prot e TrEMBL - Formatos dos ficheiros Pesquisas em Bases de dados por busca de homologias: A família BLAST - Scores estatíticos Introdução aos algoritmos em Bioinformática: Programação com R Alinhamentos simples e múltiplos de sequências. Matrizes de substituição. - Utilização dos algoritmos ClustalW, Kalign e T-Coffee . Modelos probabilísticos: - Probabilidade condicional e propriedades Inferência estatítica: inferência Bayesiana. Introdução aos processos estocásticos: Bootstrap e Jackknife Introdução à análise filogenética e árvores evolutivas: Principais métodos para a construção de árvores filogenéticas: - UPGMA; Neighbour joining, Evolução mínima, Máxima parcimónia, Máxima verosimilhança. Inferência Bayesiana.