Programa

Bioinformática

Licenciatura Bolonha em Biologia

Programa

Introdução à Bioinformática. Sequenciação de DNA Bases de dados (BD) de interesse biológico. Formatos de ficheiros. Utilização das BD: busca de similaridades: BLAST e FASTa "Scores" e Matrizes de substituição PAM e BLOSUM Algoritmia: Introdução à algoritmia com R: Vários tipo de objetos. Algoritmos para alinhamento locais ou globais de pares de sequências. Uso de programas e plataformas de análise e manipulação de sequências Motivos: Matrizes PSSM; Algoritmos de pesquisa e representação de motivos Estatística aplicada à Bioinformática: Modelos de Probabilidades: Teoria da probabilidade. Principais modelos contínuos. A sensibilidade e a especificidade. Métodos de estimação. Introdução à Inferência estatística Introdução ao clustering. Algoritmos hierárquicos aglomerativos e divisivos; Algoritmos de partição para clustering. Filogenia: Tipos de dados e de árvores; Métodos de inferência filogenética e modelos de evolução; Preparação de matrizes de dados e construção de árvores filogenéticas