Sumários

Aula 14 - Genética de Populações

11 Abril 2022, 11:30 Elsa Maria Félix Gonçalves

Genética de Populações. Lei do equilíbrio de Hardy-Weinberg. Fatores de evolução: mutação, migração e seleção. Exemplos.
T.P.C.: Exercícios de genética de populações: 1, 2, 3, 4, 5, 6.


Marcadores Moleculares (Cont)

7 Abril 2022, 14:00 Maria Leonor Mota Morais Cecílio

SNP - Single Nucleotide Polymorphism

            SNPs associados a doenças

DArT - Diversity Array Technology

Marcadores baseados em TEs

Trabalho de grupo: 

Caso de estudo de controlo de parentalidade com SSR

Caso de estudo de GWAS (Genome Wide Association Studies) com recurso s SNP:

GWAS aplicado à cor do pêlo dos cães e ao comprimento e tipo de pêlo dos cães

Detecção de SNP completamente associados e completamente desassociados

Apresentação e discussão dos resultados com toda a turma


Marcadores Moleculares

4 Abril 2022, 11:30 Maria Leonor Mota Morais Cecílio

A importância da diversidade genética nos animais de produção e os problemas de endogamia

Como avaliar a diversidade genética: Marcadores genéticos

Marcadores morfológicos, bioquímicos, cromossómicos e moleculares

Aplicações dos marcadores moleculares

Características desejáveis dos marcadores moleculares 

            Diferenciação dos marcadores baseados nas metodologias de obtenção: baseados em hibridação, PCR ou sequenciação

            Diferenciação dos marcadores baseados na quantidade de loci analisados

Obtenção e características de vários tipos de marcadores:

RFLP - Restriction Fragment Length Polymorphism. Electroforese de ácidos nucleicos; Southern blotRAPD - Randomly Amplified Polymorphic DNA

AFLP - Amplified Fragment Length Polymorphism

SSR - Simple Sequence Repeat or Microsatellite

            SSR associados a doenças

ISSR – Inter Simple Sequence Repeat

Cálculo da percentagem de bandas polimórficas

Minissatéliltes

Apresentação da base de dados OMIA – Online Mendelian Inheritance in animals

Trabalho de grupo. Escolha de um animal de produção e de uma doença genética. Sua caracterização. 


Características dos genomas dos animais de produção

31 Março 2022, 14:00 Maria Leonor Mota Morais Cecílio

Sequenciação do DNA

Trabalho de grupo acerca dos diferentes tipos de sequenciação: Sanger, Illumina, SMRT, Nanopore- Visualização de vídeos, discussão em grupo e apresentação para a turma. Discussão sobre os mesmos.

Estratégias para a sequenciação de um genoma e montagem dos genomas.

Estudos das diferentes raças através da sequenciação genómica. Exemplo dos suínos

A composição dos genomas dos caprinos.

Características estruturais dos genomas dos ruminantes: representação circus e sua interpretação


Composição dos genomas eucariotas nucleares

28 Março 2022, 11:30 Maria Leonor Mota Morais Cecílio

DNA satélite clássico, minissatélite e microssatélite

Sequências génicas sua organização e contribuição para estes genomas

Modelo de manutenção do tamanho do genoma em mamíferos e aves através de ganhos e perdas