Disciplina Curricular

Biotecnologia Aplicada à Agricultura BAplAgr

Mestrado Bolonha em Engenharia Agronómica - MEA 2024-2025

Contextos

Peso

6.0 (para cálculo da média)

Objectivos

Introdução ao tema “Biotecnologia Vegetal”; Fornecer aos alunos elementos para compreenderem e aplicarem conhecimentos de Genómica de Eucariotas, Marcadores Moleculares e suas aplicações em Agricultura (selecção assistida, fitopatologia, rendimento e qualidade, etc; Transmitir conhecimentos teóricos e práticos sobre Transferência de Genes e Expressão Génica; Regeneração de plantas por Cultura de Tecidos Estimular o estudo independente e discussão dos temas

Programa

Teóricas
1. Cultura de Tecidos
1.1.Conceitos e aplicações
1.2. Bases experimentais do Laboratório de Cultura de Tecidos
1.2.1. Meios de cultura: composição, preparação e características
1.2.2 Condições físicas do desenvolvimento das culturas
1.3. Tipos de culturas
1.3.1. Culturas de estruturas pré-determinadas
1.3.2. Cultura de estruturas desdiferenciadas
1.3.3. Cultura de células em suspensão
1.4. Propagação de plantas por cultura in vitro
1.4.1. Micropropagação em meio sólido e em BIT (bioreatores de imersão temporária)
1.4.2. Organogénese por desenvolvimento adventício
1.4.3. Embriogénese somática
1.5. Isolamento, cultura e fusão de protoplastos
1.6. Variação somaclonal e identificação de resistências
1.7. Assegurar a sobrevivência de plantas provenientes de cultura de tecidos: aclimatização
1.7.1. Stresse de transferência
1.7.2. Métodos de aclimatização
2. Material genético
2.1. Organização
2.2. Métodos de estudo
2.3. Sequenciação de DNA: métodos clássicos e métodos de alto débito
2.4. Expressão génica
3. Regulação da expressão génica. O mecanismo de RNAi e suas aplicações em Biotecnologia
4. Métodos de extração de ácidos nucleicos
5. Conceitos gerais de amplificação de DNA (PCR)
6. Marcadores moleculares
6. 1.Técnicas gerais para obtenção de marcadores. Descrição dos principais marcadores
6.2. Aplicações em agricultura
6.2.1. Identificação varietal
6.2.2. Diversidade fenética e filogenética
6.2.3. Diagnóstico de organismos patogénicos
6.2.4. Seleção assistida por marcadores
7. Técnica do PCR quantitativo (qPCR) e aplicações
8. Clonagem de genes em bactérias
8.1 Etapas envolvidas numa estratégia de clonagem
8.2 Hospedeiros de clonagem
8.3 Vectores de clonagem
8.4 Métodos de transferência de genes em bactérias
8.5 Métodos de selecção e rastreio de recombinantes
9. Métodos de transferência de genes e expressão génica
9.1. Em plantas
9.2. Deteção da expressão génica
9.3. Estudos de casos
Práticas
Preparação de um meio de cultura; Manipulação em condições asséticas; cultura in vitro de embriões de oliveira, germinação de sementes de tomate. Seguimento das culturas estabelecidas. Repicagem de manutenção de plantas micropropagadas de tomate. Repicagem para início de aclimatização.

Introdução à Bioinformática; Consulta de bases de dados.
Buscas de similaridade: O algoritmo BLAST e parâmetros para avaliar a qualidade dos alinhamentos.
Identificação de sequências semelhantes através do alinhamento múltiplos de sequências de nucleótidos ou de aminoácidos.

Extração; quantificação, desenho primers e PCR para marcadores e para deteção; géis e análise de resultados.

qPCR e análise dos resultados

Utilização do plasmídeo pUC18 na clonagem de um gene heterólogo em Escherichia coli. Avaliação dos resultados.

Alguns temas têm uma abordagem experimental.
Os trabalhos laboratoriais são realizados por grupos formados na aula prática com um número máximo de 4 estudantes.
Qualquer alteração será indicada pela(o) respectiva(o) docente.
Certas aulas têm Relatório de Grupo a entregar na aula seguinte ou uma semana após o termo do período experimental.
As aulas práticas tem presença obrigatória para ser admitido a exame final (ver Avaliação).

Métodos de ensino e avaliação

A avaliação consiste na avaliação da parte prática (5 relatórios ou pequenos questionários) que correspondem 25% da nota final (5% cada um) e dois testes que correspondem a 75% da nota final. Para passar os testes têm que ter nota mínima de 8 valores e média ≥ 9,5 valores.
O exame final corresponderá a 75% da nota final no caso dos alunos não passem nos testes ou optem por esta modalidade, para passar no exame a nota mínima é 9,5 valores. Não é possível melhoria dos testes, os alunos que quiserem melhoria da nota(s) terão que se apresentar a exame final.
A presença nas aulas práticas é obrigatória para ser admitido a exame final.

Disciplinas Execução

2024/2025 - 1º semestre