O segundo ciclo em Matemática Aplicada às Ciências Biológicas tem, como objetivo principal, complementar a formação nas áreas de Matemática, Estatística, Modelação, Simulação e Computação, munindo os licenciados da base científica acima referida.
São objetivos específicos do curso: fornecer técnicas e métodos matemático/estatísticos necessários no estudo de problemas reais; contribuir para uma melhor capacidade de interpretação matemática de problemas nas mais diversas áreas do saber; complementar a formação teórica obtida no ciclo anterior de estudos; desenvolver a interdisciplinaridade entre as áreas do conhecimento científico.