Aviso: Se está a ler esta mensagem, provavelmente, o browser que utiliza não é compatível com os "standards" recomendados pela W3C. Sugerimos vivamente que actualize o seu browser para ter uma melhor experiência de utilização deste "website". Mais informações em webstandards.org.

Warning: If you are reading this message, probably, your browser is not compliant with the standards recommended by the W3C. We suggest that you upgrade your browser to enjoy a better user experience of this website. More informations on webstandards.org.

Biologia Computacional (2 º Sem 2014/2015)

MBF

Sumários

Tipo do Turno:
Turno:
Docente:
Ordem:

29/05/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística - 8

Resolução de exercícios sobre modelos lineares mistos no R:  exercícios 1 e 2 da colecção de exercícios.

Modificado em 12/06/2015 15:23 Prof. Elsa Maria Félix Gonçalves Presenças: 2 alunos.

29/05/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística - 7

Modelo linear misto: os melhores estimadores lineares não enviesados (BLUEs) dos efeitos fixos e os melhores preditores lineares não enviesados (BLUPs) dos efeitos aleatórios. Inferência aos parâmetros de covariância: testes de razão de verosimilhanças. Comparação e selecção de modelos: testes de razão de verosimilhanças, critério de informação de Akaike e critério de informação de Bayes. Validação dos pressupostos do modelo.

Modificado em 13/06/2015 17:12 Prof. Elsa Maria Félix Gonçalves Presenças: 2 alunos.

22/05/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística - 6

Formulação geral do modelo linear misto, propriedades e alguns casos particulares. Os estimadores ANOVA, de máxima verosimilhança e de máxima verosimilhança restrita das componentes de variância para alguns casos particulares (modelos equilibrados): (1) modelo aleatório a 1 factor de efeitos aleatórios; (2) modelo misto, 1 factor de efeitos fixos e 1 factor de efeitos aleatórios, sem interacção; (3) modelo misto, 1 factor de efeitos fixos e 1 factor de efeitos aleatórios, com interacção.

Modificado em 12/06/2015 15:21 Prof. Elsa Maria Félix Gonçalves Presenças: 2 alunos.

22/05/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística - 5

Breve revisão do modelo linear: regressão linear e análise de variância.

Modificado em 12/06/2015 15:20 Prof. Elsa Maria Félix Gonçalves Presenças: 2 alunos.

15/05/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística -4

Testes de hipóteses paramétricos.
Testes não paramétricos: o teste de normalidade de Shapiro-Wilk.
Tabelas de contingência e testes do qui-quadrado.
O teste de Wilcoxon e o teste de Mann-Whitney.
Aplicações com R.

Modificado em 12/06/2015 13:47 Prof. Maria Manuela Costa Neves Figueiredo Presenças: 2 alunos.

15/05/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e estatística -3

Introdução à Inferência Estatística paramétrica e não paramétrica. Intervalos de
confiança para os parâmetros usuais em uma e duas populações.
Testes de normalidade.
Resolução de exercícios com o R.

Modificado em 12/06/2015 13:46 Prof. Maria Manuela Costa Neves Figueiredo Presenças: 2 alunos.

08/05/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística - 2

Amostragem e Estimação: conceitos básicos - amostra aleatória, estimador e estimativa.
Amostragem aleatória com e sem reposição com o R.
Propriedades dos estimadores. O método da máxima verosimilhança. Propriedades.

Modificado em 12/06/2015 13:45 Prof. Maria Manuela Costa Neves Figueiredo Presenças: 2 alunos.

08/05/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Probabilidade e Estatística -1

Apresentação e discussão dos objectivos do módulo. Discussão de pontos de interesse a ser tratados.Análise exploratória e visualização de dados.
Medidas para dados quantitativos e qualitativos. Sua obtenção no R.
Funções em R para os modelos de probabilidade mais usuais.
O Teorema Limite Central. Suas aplicações.
Ilustração com o R.

Modificado em 12/06/2015 13:43 Prof. Maria Manuela Costa Neves Figueiredo Presenças: 2 alunos.

01/05/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 22

Feriado

Modificado em 12/06/2015 08:08 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

01/05/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 21

Feriado

Modificado em 12/06/2015 08:08 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

24/04/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 18

Análise Classificatória (clustering) - algoritmo PAM.

Modificado em 12/06/2015 08:39 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

24/04/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 17

Análise Classificatória (clustering) - algoritmo kmeans.

Modificado em 12/06/2015 08:38 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

17/04/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 16

Introdução à Análise Classificatória (Clustering). Algoritmos hierárquicos aglomerativos.

Modificado em 12/06/2015 08:37 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

17/04/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 15

Análise em componentes Principais (continuação).

Modificado em 12/06/2015 08:35 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

10/04/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 14

Análise em componentes Principais.

Modificado em 12/06/2015 08:34 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

10/04/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 13

Introdução à Análise em componentes Principais.

Modificado em 12/06/2015 08:34 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

03/04/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Férias

Férias da Páscoa.

Modificado em 12/06/2015 08:06 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

03/04/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Férias

Férias da Páscoa.

Modificado em 12/06/2015 08:05 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

27/03/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 12

 

Introdução à algoritmia com R. Objetos de tipo Function definidos pelo utilizador.

Modificado em 12/06/2015 08:28 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

27/03/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 11

 

Introdução à algoritmia com R - Objetos de tipo Function.

Modificado em 12/06/2015 08:27 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

20/03/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 10

 

Introdução à algoritmia com R (continuação).

Modificado em 12/06/2015 08:23 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

20/03/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 9

 

Introdução à algoritmia com R.

Modificado em 12/06/2015 08:22 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

13/03/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Gene Onthology

Introdução à Ontologia Génica.

Os conceitos em Ontologia Génica: Funções moleculares, Processos biológicos e componentes celulares.

Exercícios práticos

Modificado em 12/06/2015 15:49 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

13/03/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Buscas de similaridades

Ferramentas para buscas de similaridades:

a família BLAST e FASTA

Alinhamentos e termos de buscas

Matrizes de substituição

Modificado em 12/06/2015 15:45 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

06/03/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Discussão de trabalhos

Discussão dos trabalhos de doutoramento e das metodologias bioinformáticas propostas

Modificado em 12/06/2015 15:42 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

06/03/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Discussão de trabalhos

Discussão dos trabalhos de doutoramento e das metodologias bioinformáticas propostas

Modificado em 12/06/2015 15:41 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

27/02/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Trabalhos de doutoramento

Apresentação dos trabalhos de doutoramento em curso. Utilização de ferramentas bioinformáticas

Modificado em 12/06/2015 15:39 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

27/02/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 3

Apresentação e discussão sobre o tratamento de dados no trabalho de doutoramento.

Modificado em 12/06/2015 08:47 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.

20/02/2015 12:30 Aula Teórico-Práticas

Apresentação

Apresentação e discussão das matérias a leccionar e métodos de avaliação

Modificado em 12/06/2015 15:37 Prof. Maria Leonor Mota Morais Cecílio Presenças: não foram contabilizadas.

20/02/2015 09:30 Aula Teórico-Práticas

Aula 1

 

Apresentação do programa da UC. Temas para trabalhos.

Modificado em 12/06/2015 08:12 Prof. Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira Presenças: não foram contabilizadas.