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BioComp/2016-2017/2-semestre
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Sumários
Biologia Computacional (2 º Sem 2016/2017)DB , DEA , DEAlim , DEAmb , DEBS , DEFRN Sumários01/06/2017 11:00 (Sala P14) Aula Extraordinária Aula 28Esclarecimentos de dúvidas sobre o trabalho de análise em componentes principais e análise classificatória.
Modificado em
25/06/2017 10:37
Presenças:
não foram contabilizadas.
30/05/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 27Análise em componentes principais e análise classificatória. Casos de estudo.
Modificado em
30/05/2017 18:31
Presenças:
não foram contabilizadas.
25/05/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 26Análise classificatória. Algoritmos Kmeans e PAM. Medidas para avaliar qualidade das classes.
Modificado em
26/05/2017 11:38
Presenças:
não foram contabilizadas.
23/05/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 25Análise classificatória. Métodos hierárquico aglomerativo e hierárquico divisivo.
Modificado em
23/05/2017 23:40
Presenças:
não foram contabilizadas.
18/05/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 24Análise Classificatória. Medidas de distância.
Modificado em
22/05/2017 15:09
Presenças:
não foram contabilizadas.
16/05/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 23Análise em componentes principais (continuação).
Modificado em
22/05/2017 15:08
Presenças:
não foram contabilizadas.
11/05/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 22Análise em componentes principais.
Modificado em
22/05/2017 15:08
Presenças:
não foram contabilizadas.
09/05/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Cinética enzimática (4)
Avaliação do módulo de cinética enzimática.
Modificado em
10/05/2017 21:26
Presenças:
7 alunos.
04/05/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Cinética enzimática (3)
Exemplos de aplicação de cinética enzimática. Determinação dos parâmetros cinéticos Km e Vmax utilizando os métodos de Lineweaver-Burk, Eadie-Hofstee, Hanes, Método Linear Directo e por ajuste directo à equação de Michaelis-Menten utilizando o Excel.
Modificado em
10/05/2017 21:25
Presenças:
7 alunos.
02/05/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Cinética enzimática (2)
Enzimas alostéricas e não alostéricas. Cinética de Michaelis-Menten. Dedução da equação de Michaelis Menten. Significado de Km e Vmax. Inibidores competitivos, não competitivos e acompetitivos e seu efeito nos parâmetros cinéticos. Reacções com dois substratos: mecanismos sequenciais e não-sequenciais. Enzimas alostéricas: modelo MWC e modelo de Koshland.
Modificado em
10/05/2017 21:21
Presenças:
7 alunos.
27/04/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Cinética enzimática (1)
Introdução às enzimas e às reacções catalizadas por enzimas. Mecanismo de funcionamento de uma enzima.Classificação e estrutura das enzimas. Medição da actividade enzimática. Factores que afectam a velocidade enzimática: temperatura, pH, força iónica, pressão, concentração de enzima, concentração de substrato, presença de activadores e inibidores.
Modificado em
10/05/2017 21:14
Presenças:
4 alunos.
20/04/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 16Introdução a "Response Surface Methodology". Delineamento factorial com 2 níveis. Adição de pontos centrais. "Central Composite Design". Determinação de condições ótimas: o método "steepest ascent" e a análise canónica. Exemplos utilizando o package rsm do R.
Modificado em
24/04/2017 17:14
Presenças:
5 alunos.
11/04/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Gene expressionMethods used to study gene expression in a few genes scale and high through put scale. Introduction to microarrays (gene Chip) and RNA-sequencing.
The gene ontology concept to make a first data analysis.
Modificado em
25/06/2017 17:13
Presenças:
não foram contabilizadas.
06/04/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Molecular Biology
Revision and introduction to the most important molecular biology concepts used in computational biology
Modificado em
25/06/2017 17:11
Presenças:
não foram contabilizadas.
04/04/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 13Regressão polinomial. Inferência em regressão linear múltipla: pressupostos e sua validação através de gráficos de resíduos; teste F de ajustamento global; estimação da variância dos erros aleatórios e dos parâmetros do modelo. Modelos e submodelos. Nota: Por incompatibilidade de horário da docente, a aula foi lecionada dia 5, quarta-feira, das 11h às 13h30, na sala P14.
Modificado em
05/04/2017 18:58
Presenças:
7 alunos.
30/03/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 12Análise exploratória de dados bivariados: nuvem de pontos, covariância e coeficiente de correlação de Pearson. Regressão linear simples e múltipla do ponto de vista descritivo. Método dos mínimos quadrados. Transformações linearizantes. Coeficiente de determinação e coeficiente de determinação ajustado.
Modificado em
31/03/2017 15:38
Presenças:
7 alunos.
28/03/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 11Análise de Variância com blocos aleatorizados, a dois fatores em delineamento fatorial equilibrado, com mais do que uma observação por célula. Intervalos de confiança de Tukey. Testes de diagnóstico de resíduos. Teste de Bartlett para homogeneidade de variâncias. Gráficos de interação. Exemplos utilizando a linguagem R. Nota: Por incompatibilidade de horário da docente, a aula foi lecionada dia 29, quarta-feira, das 11h às 13h30, na sala P14.
Modificado em
31/03/2017 15:34
Presenças:
7 alunos.
23/03/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 10Inferência Estatística: Teste t para amostras emparelhadas. Validação de pressupostos.
Modificado em
23/03/2017 17:32
Presenças:
7 alunos.
21/03/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 9Inferência Estatística: testes de hipóteses e intervalos de confiança. Testes t para uma amostra e para duas amostras independentes. Validação de pressupostos: teste de Shapiro-Wilk, teste F para comparação de variâncias. Nota: Por incompatibilidade de horário da docente, a aula foi lecionada dia 22, quarta-feira, das 11h às 13h30, na sala P14.
Modificado em
22/03/2017 15:59
Presenças:
7 alunos.
16/03/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas RSMCase study of apllication of RSM methodoloy: preparation of biodegradable films with increased resistance to water
Modificado em
12/07/2017 14:31
Presenças:
5 alunos.
14/03/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 7Revisões de estatística descritiva univariada.
Modificado em
14/03/2017 17:49
Presenças:
não foram contabilizadas.
09/03/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 6Objectos de tipo function (cont).
Modificado em
14/03/2017 17:49
Presenças:
não foram contabilizadas.
07/03/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 5Objectos de tipo function.
Modificado em
14/03/2017 17:48
Presenças:
não foram contabilizadas.
02/03/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 4Introdução ao R: leitura e escrita em ficheiros. Gráficos.
Modificado em
14/03/2017 17:46
Presenças:
7 alunos.
23/02/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 3Introdução ao R. Objectos de tipo matrix, list e data.frame.
Modificado em
14/03/2017 10:26
Presenças:
7 alunos.
21/02/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula 2Introdução ao R. Objectos de tipo vector.
Modificado em
14/03/2017 10:24
Presenças:
7 alunos.
16/02/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Aula 1Apresentação da unidade curricular: programa e avaliação. Conversa com os alunos sobre os seus programas de doutoramento.
Modificado em
14/03/2017 10:23
Presenças:
6 alunos.
14/02/2017 14:00 Aula Teórico-Práticas Aula (alteração de data)Esta aula será leccionada a 1 de junho a pedido dos alunos.
Modificado em
25/06/2017 10:34
Presenças:
não foram contabilizadas.
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