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BioMol/2017-2018/1-semestre
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Sumários
Biologia Molecular (1 º Sem 2017/2018)Sumários19/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Correcção de testesCorrecção dos testes de frequência
Modificado em
20/12/2017 16:13
Presenças:
não foram contabilizadas.
18/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Correcçãao de testesCorrecção de testes de frequência
Modificado em
18/12/2017 14:21
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não foram contabilizadas.
14/12/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Regulação da expessão génicaRegulação em relação com mecanismos de desenvolvimento. Níveis de regulação da expressão génica. Regulação de iniciação da transcrição. Regulação positiva e negativa. O operão lactose em E. coli.
Modificado em
18/12/2017 14:25
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não foram contabilizadas.
14/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Regulação da expressão génicaRegulação em relação com mecanismos de desenvolvimento. Níveis de regulação da expressão génica. Regulação de iniciação da transcrição. Regulação positiva e negativa. O operão lactose em E. coli.
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18/12/2017 14:26
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não foram contabilizadas.
12/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas testeteste de frequência
Modificado em
18/12/2017 14:27
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não foram contabilizadas.
11/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas testeteste de frequência
Modificado em
18/12/2017 14:28
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não foram contabilizadas.
07/12/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre recombinação e tecnologia de DNA recombinante.
Modificado em
20/12/2017 16:52
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não foram contabilizadas.
07/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre recombinação e tecnologia de DNA recombinante.
Modificado em
20/12/2017 16:51
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05/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinanteDetecção de moléculas específicas em misturas complexas: Análise de Southern, Northern e Western. Clonagem de DNA. Bibliotecas genómica e de cDNA. Polymerase chain reaction.
Modificado em
20/12/2017 16:50
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04/12/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinante
Detecção de moléculas específicas em misturas complexas: Análise de Southern, Northern e Western. Clonagem de DNA. Bibliotecas genómica e de cDNA. Polymerase chain reaction.
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20/12/2017 16:50
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30/11/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinante
Tecnologia de DNA recombinante. Enzimas de restrição. Mapas de restrição. Ligação. Marcação radioactiva de moléculas de DNA. Sequenciação de DNA. Métodos químico e enzimático. DNA footprinting no estudo de interacções DNA-proteina.
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20/12/2017 16:48
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30/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia de DNA recombinante
Tecnologia de DNA recombinante. Enzimas de restrição. Mapas de restrição. Ligação. Marcação radioactiva de moléculas de DNA. Sequenciação de DNA. Métodos químico e enzimático. DNA footprinting no estudo de interacções DNA-proteina.
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20/12/2017 16:47
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28/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Elementos genéticos móveis
Elementos genéticos móveis: Virus e transposões. Ciclos de infecção viral. Integração de genomas virais em genomas hospedeiros e recombinação específica. Retrovirus e transcritase reversa. Transposões: Retrotransposões e transposões de DNA. Transposição replicativa e conservativa.
Modificado em
20/12/2017 16:46
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27/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Elementos genéticos móveis
Elementos genéticos móveis: Virus e transposões. Ciclos de infecção viral. Integração de genomas virais em genomas hospedeiros e recombinação específica. Retrovirus e transcritase reversa. Transposões: Retrotransposões e transposões de DNA. Transposição replicativa e conservativa.
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20/12/2017 16:45
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23/11/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Mecanismos de recombinação específica (site –specific recombination). Recombinases e locais de recombinação específica. Consequências da recombinação específica: Integração de moléculas de DNA, inversões e delecções. Problemas.
Modificado em
20/12/2017 16:44
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não foram contabilizadas.
23/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Mecanismos de recombinação específica (site –specific recombination). Recombinases e locais de recombinação específica. Consequências da recombinação específica: Integração de moléculas de DNA, inversões e delecções. Problemas.
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20/12/2017 16:44
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21/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Recombinação homóloga: Aspectos gerais sobre recombinação. Modelos de recombinação. Modelo de Holiday. Via recBCD em E. coli. Consequências da recombinação: crossing-over e patch-recombination.
Modificado em
20/12/2017 16:43
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não foram contabilizadas.
20/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Recombinação homóloga: Aspectos gerais sobre recombinação. Modelos de recombinação. Modelo de Holiday. Via recBCD em E. coli. Consequências da recombinação: crossing-over e patch-recombination.
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20/12/2017 16:42
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16/11/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas ProblemasProblemas sobre reparação e replicação do DNA. Actividade exo 3'-5' da DNA polimerase. Actividade helicase.
Modificado em
20/12/2017 16:41
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não foram contabilizadas.
16/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas sobre reparação e replicação do DNA. Actividade exo 3'-5' da DNA polimerase. Actividade helicase.
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20/12/2017 16:40
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14/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação de telómeros
"Mismatch Repair System" em procariotas e eucariotas. Problema da replicação das extremidades 3'. Telómeros e telomerase.
Modificado em
20/12/2017 16:38
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13/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação de telómeros
"Mismatch Repair System" em procariotas e eucariotas. Problema da replicação das extremidades 3'. Telómeros e telomerase.
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20/12/2017 16:37
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09/11/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. DNA polimerase, molde e reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. Paralelo com transcrição. Actividade exo 3’-5’. Simetria e assimetria na forquilha de replicação. Fragmentos de Okasaki.. Proteinas SSB e helicases. “Priming” e DNA primase. Topoisomerases. “Sliding DNA clamp” e processividade da DNA polimerase. RNAseH e ligase.
Modificado em
20/12/2017 16:36
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09/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. DNA polimerase, molde e reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. Paralelo com transcrição. Actividade exo 3’-5’. Simetria e assimetria na forquilha de replicação. Fragmentos de Okasaki.. Proteinas SSB e helicases. “Priming” e DNA primase. Topoisomerases. “Sliding DNA clamp” e processividade da DNA polimerase. RNAseH e ligase.
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20/12/2017 16:35
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07/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Reparação de danos no DNA
Reparação do DNA. Diferença entre erro e dano. Tipos de danos a que o DNA se encontra sujeito: Despurinação, desaminação espontânea da citosina e dimerização de pirimidinas. Reparação por substituição de bases ou por substituição de nucleótidos. “Nick” e “gap”. AP-endonucleases, glicosilases, DNA polimerase e DNA ligase. Sintese de DNA.
Modificado em
20/12/2017 16:35
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06/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Reparação de danos no DNA
Reparação do DNA. Diferença entre erro e dano. Tipos de danos a que o DNA se encontra sujeito: Despurinação, desaminação espontânea da citosina e dimerização de pirimidinas. Reparação por substituição de bases ou por substituição de nucleótidos. “Nick” e “gap”. AP-endonucleases, glicosilases, DNA polimerase e DNA ligase. Sintese de DNA.
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20/12/2017 16:34
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02/11/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas testeteste de frequência
Modificado em
18/12/2017 14:45
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não foram contabilizadas.
02/11/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas testeteste de frequência
Modificado em
18/12/2017 14:46
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não foram contabilizadas.
31/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas RevisõesRevisão de problemas de expressão génica.
Modificado em
20/12/2017 16:33
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não foram contabilizadas.
30/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas RevisõesRevisão de problemas de expressão génica
Modificado em
20/12/2017 16:32
Presenças:
não foram contabilizadas.
26/10/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas. Ensaios para determinar código genético. Descobrir quadro de leitura aberto longo. Descobrir sequências consensus.
Modificado em
20/12/2017 16:31
Presenças:
não foram contabilizadas.
26/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas. Ensaios para determinar código genético. Descobrir quadro de leitura aberto longo. Descobrir sequências consensus.
Modificado em
20/12/2017 16:31
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24/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas sobre transcrição e tradução
Problemas sobre transcrição e tradução. Efeitos de mutações: Substituições (missense, non-sense, silent), delecções e inserções (frameshifts, inserções ou delecções de aminoácidos).
Modificado em
20/12/2017 16:30
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não foram contabilizadas.
23/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas sobre trasncrição e tradução
Problemas sobre transcrição e tradução. Efeitos de mutações: Substituições (missense, non-sense, silent), delecções e inserções (frameshifts, inserções ou delecções de aminoácidos).
Modificado em
20/12/2017 16:29
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não foram contabilizadas.
19/10/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Tradução
Iniciação da tradução em procariotas e eucariotas: Problemas particulares. Quadros de leitura. Organização de genes em relação com a iniciação da tradução: organização monocistrónica (eucariotas) e policistrónica (operões procarióticos).
Modificado em
20/12/2017 16:28
Presenças:
não foram contabilizadas.
19/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Iniciação da tradução em procariotas e eucariotas: Problemas particulares. Quadros de leitura. Organização de genes em relação com a iniciação da tradução: organização monocistrónica (eucariotas) e policistrónica (operões procarióticos).
Modificado em
20/12/2017 16:28
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17/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Visão geral e código genético. Ribossomas, tRNA, aminoacil-tRNA e peptidil-tRNA. Tradução como mecanismo envolvendo dois passos de adaptação acoplados: (i) Aminoacil-tRNA sintetases (ii) Emparelhamento anticodão-codão. Ciclo de alongamento (entrada, ligação péptica e translocação). Terminação. Poliribossomas.
Modificado em
20/12/2017 16:27
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não foram contabilizadas.
16/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Visão geral e código genético. Ribossomas, tRNA, aminoacil-tRNA e peptidil-tRNA. Tradução como mecanismo envolvendo dois passos de adaptação acoplados: (i) Aminoacil-tRNA sintetases (ii) Emparelhamento anticodão-codão. Ciclo de alongamento (entrada, ligação péptica e translocação). Terminação. Poliribossomas.
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20/12/2017 16:26
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12/10/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Poli-adenilação e splicing
Clivagem, poliadenilação e terminação da transcrição em eucariotas. Splicing. Transcrito primário, Intrões e exões. Estrutura de intrões. Estrutura e montagem do spliceosome. Splicing alternativo e ESEs (exonic splicing elements).
Modificado em
20/12/2017 16:26
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12/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Poli-adenilação e splicing
Clivagem, poliadenilação e terminação da transcrição em eucariotas. Splicing. Transcrito primário, Intrões e exões. Estrutura de intrões. Estrutura e montagem do spliceosome. Splicing alternativo e ESEs (exonic splicing elements).
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20/12/2017 16:25
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10/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Terminação da transcrição em procariotas: Terminação independente e dependente de rho. Estruturas de terminadores. Modificações post-transcricionais em eucariotas (RNA sintetizado pela RNA polimerase II): Capping, splicing e poli-adenilação.
Modificado em
20/12/2017 16:24
Presenças:
não foram contabilizadas.
09/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Terminação da transcrição em procariotas: Terminação independente e dependente de rho. Estruturas de terminadores. Modificações post-transcricionais em eucariotas (RNA sintetizado pela RNA polimerase II): Capping, splicing e poli-adenilação.
Modificado em
20/12/2017 16:23
Presenças:
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03/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas TranscriçãoTranscrição. Sintese de RNA dependente de DNA. Molde. Reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. RNA polimerases. Funções durante a fase de alongamento. Problemas particulares na iniciação da transcrição. Promotores e sua interacção com RNA polimerase e factores de iniciação. Sequências consenso.
Modificado em
20/12/2017 16:23
Presenças:
não foram contabilizadas.
02/10/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Transcrição. Sintese de RNA dependente de DNA. Molde. Reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. RNA polimerases. Funções durante a fase de alongamento. Problemas particulares na iniciação da transcrição. Promotores e sua interacção com RNA polimerase e factores de iniciação. Sequências consenso.
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20/12/2017 16:22
Presenças:
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28/09/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura dos ácidos nucleicos. Bases azotadas, pentoses e grupos fosfato. Ligação N-glicosídica (base-pentose), ligação éster (pentose-fosfato). Nucleósidos e nucleótidos (nucleósidos monofosfato). Nucleósidos di e tri fosfato. Nomenclatura. Polaridade 5’-3’ de nucleótidos. Ligação fosfo-diéster (entre nucleótidos). Polaridade 5’-3’ de cadeias polinucleotídicas. Complementaridade de bases: Interacções por pontes de hidrogénio A-T e C-G (especificidade no emparelhamento). A hélice dupla de DNA: Duas cadeias complementares anti-paralelas. Propriedades da hélice: distância entre pares de bases, passo, diâmetro.
Modificado em
18/12/2017 14:44
Presenças:
não foram contabilizadas.
28/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura dos ácidos nucleicos. Bases azotadas, pentoses e grupos fosfato. Ligação N-glicosídica (base-pentose), ligação éster (pentose-fosfato). Nucleósidos e nucleótidos (nucleósidos monofosfato). Nucleósidos di e tri fosfato. Nomenclatura. Polaridade 5’-3’ de nucleótidos. Ligação fosfo-diéster (entre nucleótidos). Polaridade 5’-3’ de cadeias polinucleotídicas. Complementaridade de bases: Interacções por pontes de hidrogénio A-T e C-G (especificidade no emparelhamento). A hélice dupla de DNA: Duas cadeias complementares anti-paralelas. Propriedades da hélice: distância entre pares de bases, passo, diâmetro.
Modificado em
18/12/2017 14:43
Presenças:
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26/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura e função de proteínas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos: Estrutura geral e classificação (acídicos, básicos, polares não carregados e apolares). A ligação peptídica. Níveis de estrutura de proteínas: Estrutura primária (sequência de aminoácidos). Ligações não covalentes (ex: pontes de hidrogénio) entre aminoácidos da mesma cadeia polipeptídica e estruturas secundárias (hélice alfa e folha beta). Interacções entre elementos de estrutura secundária implicam estrutura terciária. Estrutura quaternária resulta de interacções entre cadeias polipeptidicas. Importância das interacções fracas no estabelecimento da estrutura 3D de proteínas. Função depende de estrutura 3D. Estrutura 3D depende em última instância de estrutura primária.
Modificado em
18/12/2017 14:42
Presenças:
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25/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura e função de proteínas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos: Estrutura geral e classificação (acídicos, básicos, polares não carregados e apolares). A ligação peptídica. Níveis de estrutura de proteínas: Estrutura primária (sequência de aminoácidos). Ligações não covalentes (ex: pontes de hidrogénio) entre aminoácidos da mesma cadeia polipeptídica e estruturas secundárias (hélice alfa e folha beta). Interacções entre elementos de estrutura secundária implicam estrutura terciária. Estrutura quaternária resulta de interacções entre cadeias polipeptidicas. Importância das interacções fracas no estabelecimento da estrutura 3D de proteínas. Função depende de estrutura 3D. Estrutura 3D depende em última instância de estrutura primária.
Modificado em
18/12/2017 14:41
Presenças:
não foram contabilizadas.
21/09/2017 11:00 Aula Teórico-Práticas Pequenas molçéculas biológicas
Pequenas moléculas biológicas. Água, ligações covalentes e ligações de hidrogénio. Moléculas hidrofílicas e hidrofóbicas. Ácido/base. Esqueletos de carbono. Tipos frequentes de combinações de átomos: Metil, hidroxil, carboxil, amino. Commpostos com C e O: Alcool, aldeído, cetona e éster. Compostos com C e N: aminas e amidas. Fosfatos: Fosfato inorgânico, éster de fosfato e ácido anídrico. Principais pequenas moléculas biológicas: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.
Modificado em
18/12/2017 14:40
Presenças:
não foram contabilizadas.
21/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Pequenas moléculas biológicas
Pequenas moléculas biológicas. Água, ligações covalentes e ligações de hidrogénio. Moléculas hidrofílicas e hidrofóbicas. Ácido/base. Esqueletos de carbono. Tipos frequentes de combinações de átomos: Metil, hidroxil, carboxil, amino. Commpostos com C e O: Alcool, aldeído, cetona e éster. Compostos com C e N: aminas e amidas. Fosfatos: Fosfato inorgânico, éster de fosfato e ácido anídrico. Principais pequenas moléculas biológicas: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.
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18/12/2017 14:39
Presenças:
não foram contabilizadas.
19/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Apresentações
Apresentações. Regras de funcionamento: Assiduidade, avaliação (dois testes intercalares e exame final com pesos de 30% e 70% respectivamente). Elementos de estudo: Bibliografia principal: Livros de texto Molecular Biology of the Gene (MBG) e Molecular Biology of the Cell (MBC), animações em MBG, fichas de problemas. Visão geral do programa à luz do dogma central da biologia molecular.
Modificado em
18/12/2017 14:38
Presenças:
não foram contabilizadas.
18/09/2017 08:15 Aula Teórico-Práticas Apresentações
Apresentações. Regras de funcionamento: Assiduidade, avaliação (dois testes intercalares e exame final com pesos de 30% e 70% respectivamente). Elementos de estudo: Bibliografia principal: Livros de texto Molecular Biology of the Gene (MBG) e Molecular Biology of the Cell (MBC), animações em MBG, fichas de problemas. Visão geral do programa à luz do dogma central da biologia molecular.
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18/12/2017 14:37
Presenças:
não foram contabilizadas.
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