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BioMol/2014-2015/1-semestre
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Sumários
Biologia Molecular (1 º Sem 2014/2015)Sumários19/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas TesteCorrecção do teste. Regulação positiva e negativa do operão lac.
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22/12/2014 13:14
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18/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas TesteCorrecção do teste. Regulação positiva e negativa do operão lac.
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22/12/2014 13:14
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16/12/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas TesteTeste
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22/12/2014 13:13
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16/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas TesteTeste
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22/12/2014 13:13
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12/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Regulação da expressão génica
Regulação da expressão génica. Regulação positiva e negativa. Níveis de regulação: Transcrição, Processamento de RNA, Transporte, tradução, modificação post-traducional. Regulação da iniciação da transcrição (operão lac em E. coli).
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22/12/2014 13:13
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11/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Regulação da expressão génica
Regulação da expressão génica. Regulação positiva e negativa. Níveis de regulação: Transcrição, Processamento de RNA, Transporte, tradução, modificação post-traducional. Regulação da iniciação da transcrição (operão lac em E. coli).
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22/12/2014 13:13
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09/12/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Isolamento (purificação) de moléculas específicas de DNA (“cloning”). Vectores de clonagem (plasmídeos e DNA fágico). Transformação. Bibliotecas genómica e de cDNA. Identificação de clones portadores de segmentos específicos numa biblioteca. A “Polymerase Chain Reaction”.
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22/12/2014 13:11
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09/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Isolamento (purificação) de moléculas específicas de DNA (“cloning”). Vectores de clonagem (plasmídeos e DNA fágico). Transformação. Bibliotecas genómica e de cDNA. Identificação de clones portadores de segmentos específicos numa biblioteca. A “Polymerase Chain Reaction”.
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22/12/2014 13:11
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05/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas tecnologia do DNA recombinante
Método de Sanger (dideoxi-chain-termination) para sequenciar moléculas de DNA. Métodos para detectar moléculas específicas numa mistura complexa de moléculas: Southern, Northern e Western Blotting.
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22/12/2014 13:11
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04/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas tecnologia do DNA recombinante
Método de Sanger (dideoxi-chain-termination) para sequenciar moléculas de DNA. Métodos para detectar moléculas específicas numa mistura complexa de moléculas: Southern, Northern e Western Blotting.
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02/12/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Mapas de restrição obtidos a partir de digestão parcial de moléculas de DNA marcadas numa extremidade. Método químico (Maxam and Gilbert) para determinar sequências de nucleótidos de moléculas de DNA. Interacções proteínas-DNA e DNase footprinting.
Modificado em
22/12/2014 13:10
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02/12/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Mapas de restrição obtidos a partir de digestão parcial de moléculas de DNA marcadas numa extremidade. Método químico (Maxam and Gilbert) para determinar sequências de nucleótidos de moléculas de DNA. Interacções proteínas-DNA e DNase footprinting.
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22/12/2014 13:10
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28/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Tecnologia do DNA recombinante. Enzimas de restrição. Mapas de restrição. Usos dos mapas de restrição na comparação de moléculas de DNA. Marcação de moléculas de DNA com isótopos radioactivos.
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22/12/2014 13:09
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27/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tecnologia do DNA recombinante
Tecnologia do DNA recombinante. Enzimas de restrição. Mapas de restrição. Usos dos mapas de restrição na comparação de moléculas de DNA. Marcação de moléculas de DNA com isótopos radioactivos.
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22/12/2014 13:09
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25/11/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Transposões
Transposões. Retrotransposões: relação com retrovírus. Transposões: estrutura e mecanismos de transposição. Transposição conservativa (cut and paste) e replicativa. Consequências da transposição.
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22/12/2014 13:09
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25/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Transposões
Transposões. Retrotransposões: relação com retrovírus. Transposões: estrutura e mecanismos de transposição. Transposição conservativa (cut and paste) e replicativa. Consequências da transposição.
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22/12/2014 13:09
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21/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Virus
Elementos genéticos móveis. Virus, transpões e plasmídeos. Virus de DNA e de RNA: Ciclos de infecção e estratégias de replicação. Ciclo lítico e ciclo lisogénico no bacteriófago lambda. Integração de genomas virais em genomas hospedeiros e recombinação específica.
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22/12/2014 13:08
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20/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Virus
Elementos genéticos móveis. Virus, transpões e plasmídeos. Virus de DNA e de RNA: Ciclos de infecção e estratégias de replicação. Ciclo lítico e ciclo lisogénico no bacteriófago lambda. Integração de genomas virais em genomas hospedeiros e recombinação específica.
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22/12/2014 13:08
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18/11/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Recombinação
Problemas sobre recombinação. Topologia da recombinação. Detecção da actividade recBCD e da ligação de SSBs.
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22/12/2014 13:07
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18/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação
Problemas sobre recombinação. Topologia da recombinação. Detecção da actividade recBCD e da ligação de SSBs.
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22/12/2014 13:07
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14/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Recombinação específica. Recombinases e locais de recombinação específica. Efeito da orientação de locais de recombinação específica no resultado da recombinação.
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22/12/2014 13:06
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13/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação específica
Recombinação específica. Recombinases e locais de recombinação específica. Efeito da orientação de locais de recombinação específica no resultado da recombinação.
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22/12/2014 13:06
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11/11/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Recombinação homóloga. Modelo de Holliday. Modelo “Double-Strand Break” em E. coli. Proteinas REC e RUV. “Patch recombination” e “crossing-over”. Conversão génica.
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22/12/2014 13:05
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11/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Recombinação homóloga
Recombinação homóloga. Modelo de Holliday. Modelo “Double-Strand Break” em E. coli. Proteinas REC e RUV. “Patch recombination” e “crossing-over”. Conversão génica.
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22/12/2014 13:05
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07/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas REplicação do DNA
Problemas sobre replicação do DNA. Detecção da actividade exonuclease da DNA polimerase. Detecção da actividade helicase.
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22/12/2014 13:05
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06/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas REplicação do DNA
Problemas sobre replicação do DNA. Detecção da actividade exonuclease da DNA polimerase. Detecção da actividade helicase.
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22/12/2014 13:05
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04/11/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
“Mismatch Repair System” em eucariotas e procariotas. Problema da replicação das extremidades 3’. Telomerase e manutenção do comprimento de cromossomas lineares.
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22/12/2014 13:04
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04/11/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
“Mismatch Repair System” em eucariotas e procariotas. Problema da replicação das extremidades 3’. Telomerase e manutenção do comprimento de cromossomas lineares.
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22/12/2014 13:04
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31/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. Sintese de “primers” e DNA primase. Eliminação de “primers”, RNAse H e reparação de GAPs. Topoisomerases. Processividade da DNA polimerase e “DNA sliding clamp”. Coordenação da síntese continua e descontínua.
Modificado em
22/12/2014 13:03
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30/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. Sintese de “primers” e DNA primase. Eliminação de “primers”, RNAse H e reparação de GAPs. Topoisomerases. Processividade da DNA polimerase e “DNA sliding clamp”. Coordenação da síntese continua e descontínua.
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28/10/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. Replicação semi-conservativa. Actividades da DNA polimerase. Síntese na direcção 5’-3’. Auto-correcção e actividade exonuclease 3’-5’. Origens de replicação e forquilhas de replicação. Cadeia contínua (leading strand) e cadeia descontínua (lagging strand). Actividade helicase. SSBs.
Modificado em
22/12/2014 12:59
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28/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Replicação do DNA
Replicação do DNA. Replicação semi-conservativa. Actividades da DNA polimerase. Síntese na direcção 5’-3’. Auto-correcção e actividade exonuclease 3’-5’. Origens de replicação e forquilhas de replicação. Cadeia contínua (leading strand) e cadeia descontínua (lagging strand). Actividade helicase. SSBs.
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22/12/2014 12:59
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24/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Reparação de DNAReparação do DNA. Diferença entre erro e dano. Tipos de danos a que o DNA se encontra sujeito: Despurinação, desaminação espontânea da citosina e dimerização de pirimidinas. Reparação por substituição de bases ou por substituição de nucleótidos. “Nick” e “gap”. AP-endonucleases, glicosilases, DNA polimerase e DNA ligase. Sintese de DNA. Actividade polimerase e exonuclease.
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27/10/2014 10:23
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23/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Reparação de DNA.
Reparação do DNA. Diferença entre erro e dano. Tipos de danos a que o DNA se encontra sujeito: Despurinação, desaminação espontânea da citosina e dimerização de pirimidinas. Reparação por substituição de bases ou por substituição de nucleótidos. “Nick” e “gap”. AP-endonucleases, glicosilases, DNA polimerase e DNA ligase. Sintese de DNA. Actividade polimerase e exonuclease.
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27/10/2014 10:22
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21/10/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas. Estabelecimento do código genético: Experiências de Khorana. Iniciação da tradução em eucariotas. Sequência “consensus” (Kozak). Procura de ORFs em sequência de cDNA.
Modificado em
27/10/2014 10:20
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21/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas. Estabelecimento do código genético: Experiências de Khorana. Iniciação da tradução em eucariotas. Sequência “consensus” (Kozak). Procura de ORFs em sequência de cDNA.
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27/10/2014 10:20
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17/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas sobre transcrição e tradução. Efeitos de substituições de nucleótidos: Mutações silenciosas, missense e non-sense. Delecções (frameshifts) e inversões.
Modificado em
27/10/2014 10:19
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16/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Problemas
Problemas sobre transcrição e tradução. Efeitos de substituições de nucleótidos: Mutações silenciosas, missense e non-sense. Delecções (frameshifts) e inversões.
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27/10/2014 10:18
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14/10/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Tradução
Iniciação da tradução em procariotas e eucariotas: Problemas particulares. Quadros de leitura. Organização de genes em relação com a iniciação da tradução: organização monocistrónica (eucariotas) e policistrónica (operões procarióticos).
Modificado em
27/10/2014 10:17
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14/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Iniciação da tradução em procariotas e eucariotas: Problemas particulares. Quadros de leitura. Organização de genes em relação com a iniciação da tradução: organização monocistrónica (eucariotas) e policistrónica (operões procarióticos).
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27/10/2014 10:17
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10/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Tradução. Visão geral e código genético. Ribossomas, tRNA, aminoacil-tRNA e peptidil-tRNA. Tradução como mecanismo envolvendo dois passos de adaptação acoplados: (i) Aminoacil-tRNA sintetases (ii) Emparelhamento anticodão-codão. Ciclo de alongamento (entrada, ligação péptica e translocação). Terminação. Poliribossomas.
Modificado em
27/10/2014 10:16
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09/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Tradução
Tradução. Visão geral e código genético. Ribossomas, tRNA, aminoacil-tRNA e peptidil-tRNA. Tradução como mecanismo envolvendo dois passos de adaptação acoplados: (i) Aminoacil-tRNA sintetases (ii) Emparelhamento anticodão-codão. Ciclo de alongamento (entrada, ligação péptica e translocação). Terminação. Poliribossomas.
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27/10/2014 10:16
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07/10/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Processamento ed RNA
Processamento de RNA (Splicing). Transcrito primário, Intrões e exões. Estrutura de intrões. Estrutura e montagem do "spliceosome". Splicing alternativo e ESEs (exonic splicing elements).
Modificado em
27/10/2014 10:15
Presenças:
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07/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Processamento de RNA
Processamento de RNA (Splicing). Transcrito primário, Intrões e exões. Estrutura de intrões. Estrutura e montagem do "spliceosome". Splicing alternativo e ESEs (exonic splicing elements).
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27/10/2014 10:14
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03/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Terminação da transcrição em procariotas: Terminação independente e dependente de rho. Terminação da transcrição em eucariotas e poli-adenilação.
Modificado em
27/10/2014 10:13
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02/10/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Terminação da transcrição em procariotas: Terminação independente e dependente de rho. Terminação da transcrição em eucariotas e poli-adenilação.
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27/10/2014 10:12
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30/09/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Transcrição. Sintese de RNA dependente de DNA. Molde. Reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. RNA polimerases. Funções durante a fase de alongamento. Problemas particulares na Iniciação da transcrição. Promotores.
Modificado em
27/10/2014 10:11
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30/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Transcrição
Transcrição. Sintese de RNA dependente de DNA. Molde. Reacção geral de adição de um nucleótido a uma cadeia em crescimento. Direcções. RNA polimerases. Funções durante a fase de alongamento. Problemas particulares na Iniciação da transcrição. Promotores.
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27/10/2014 10:11
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26/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura de ácidos nucleicos. Nucleósidos, nucleótidos e diferenças DNA-RNA. Ligações N-glicosídica e fosfo-diéster. Direcções (5’-3’). Anti-paralelismo de hélices duplas. Propriedades da hélice. Desnaturação e renaturação de cadeias duplas. Hibridação molecular. Estrutura secundária de cadeias simples.
Modificado em
27/10/2014 10:10
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25/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura de ácidos nucleicos
Estrutura de ácidos nucleicos. Nucleósidos, nucleótidos e diferenças DNA-RNA. Ligações N-glicosídica e fosfo-diéster. Direcções (5’-3’). Anti-paralelismo de hélices duplas. Propriedades da hélice. Desnaturação e renaturação de cadeias duplas. Hibridação molecular. Estrutura secundária de cadeias simples.
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27/10/2014 10:09
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23/09/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Estrutura e função de proteinas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos. Ligação peptídica. Estruturas: Primária, secundária, terciária e quaternária. Domínios e subunidades. Função depende de estrutura tri-dimensional que por seu turno depende da estrutura primária (sequência de aminoácidos).
Modificado em
27/10/2014 10:07
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23/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Estrutura ee função de proteinas
Estrutura e função de proteínas. Aminoácidos. Ligação peptídica. Estruturas: Primária, secundária, terciária e quaternária. Domínios e subunidades. Função depende de estrutura tri-dimensional que por seu turno depende da estrutura primária (sequência de aminoácidos).
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27/10/2014 10:06
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19/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Pequenas moléculas biológicasÁgua. Ligação covalente. Ligação de hidrgénio. crácter polar. hidrofilia e hidrofobia. Ácidos e bases. esqueletos de carbono. Tipos muito frequentes de combinações de átomos. Compostos com C-O. Compostos com C-N. Moléculas com menos de 30 átomos de carbono: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.Aminoácidos como subunidades de proteinas e nucleótidos como subunidades de ácidos nucleicos. Literatura: Alberts et al (1994). Molecular Biology of teh Cell (third edition). pp 41-60
Modificado em
24/09/2014 11:55
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18/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Pequenas moléculas biológicasÁgua. Ligação covalente. Ligação de hidrgénio. crácter polar. hidrofilia e hidrofobia. Ácidos e bases. esqueletos de carbono. Tipos muito frequentes de combinações de átomos. Compostos com C-O. Compostos com C-N. Moléculas com menos de 30 átomos de carbono: Açucares, ácidos gordos, aminoácidos e nucleotidos.Aminoácidos como subunidades de proteinas e nucleótidos como subunidades de ácidos nucleicos. Literatura: Alberts et al (1994). Molecular Biology of teh Cell (third edition). pp 41-60
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24/09/2014 11:55
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16/09/2014 11:00 Aula Teórico-Práticas Apresentação
Apresentação. Regras de avaliação. Bibliografia. Visão geral do programa.
Modificado em
27/10/2014 10:04
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16/09/2014 08:15 Aula Teórico-Práticas Apresentação
Apresentação. Regras de avaliação. Bibliografia. Visão geral do programa.
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27/10/2014 10:05
Presenças:
não foram contabilizadas.
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