Sumários

Estatística | Resolução de exercícios (TP10)

23 outubro 2026, 14:00 • Maria João Teixeira Martins

Resolução dos Exercícios 1.1 (Estatística do BLAST) e 2.3 (Testes Múltiplos).


Estatística | Resolução de exercícios (TP09)

23 outubro 2026, 11:00 • Maria João Teixeira Martins

Resolução dos Exercícios 1.1 (Estatística do BLAST) e 2.3 (Testes Múltiplos).


Estatística | A Estatística do BLAST (continuação) e Testes Múltiplos

22 outubro 2026, 14:30 • Maria João Teixeira Martins

A Estatística do BLAST (continuação)
Distribuição assintótica (sequências longas) da pontuação (score) de alinhamentos HSP. O E-value como medida da significância do alinhamento. Relação com o p-value do teste. Seleção do sistema ótimo de pontuação com base nas target frequencies e na percentagem de identidades.
Bit-score. Relação entre bit-score e E-value e entre bit-score e dimensão da base de dados. 
(slides 35-51)

Testes Múltiplos
O problema dos testes de hipóteses múltiplos. A Family-Wise Error Rate (FWER) como uma medida de erro global, que pode ser controlada através da correção de Bonferroni. Medida de erro alternativa: a False Discovery Rate (FDR). O algoritmo de Benjamini-Hochberg como forma de controlar a FDR. (slides 57 a 78)


Estatística | A Estatística do BLAST

21 outubro 2026, 14:30 • Maria João Teixeira Martins

Revisões de Testes de Hipóteses. Teste a uma proporção como exemplo.

A Estatística do alinhamento de sequências no BLAST. Sistemas de pontuação, alinhamento de mais alta pontuação (High Scoring Segment Pairs, HSP), teste de hipóteses no alinhamento de sequências, teoria estatística de Karlin e Altschul (1990) para alinhamentos locais sem gaps.
(Slides 1 a 34)



Alinhamento de sequências

16 outubro 2026, 14:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Algoritmo de Needlman-Wunsch para alinhamento global de pares de seqências. Algoritmo de Smith-Waterman para alinhamento local de pares de sequências. Introdução ao Blast. Exercícios de alinhamentos. Exercício de algoritmia com python (slides exercício 5).