Sumários
Alinhamento de sequências
16 outubro 2026, 11:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
Algoritmo de Needlman-Wunsch para alinhamento global de pares de seqências. Algoritmo de Smith-Waterman para alinhamento local de pares de sequências. Introdução ao Blast. Exercícios de alinhamentos. Exercício de algoritmia com python (slides exercício 5).
Alinhamento de sequências
15 outubro 2026, 14:30 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
Algoritmo de Needlman-Wunsch para alinhamento global de pares de seqências.
Bases de dados e BLAST
14 outubro 2026, 14:30 • Dora Batista
Bases de dados de interesse biológico: tipos, conteúdo e acesso. Pesquisa no Entrez e interação entre bases de dados. Colaboração internacional INSDC: NCBI, EMBL e DDJB. Organização de dados e especificidades. Bases de dados não-redundantes. Estratégias de pesquisa de bases de dados: identificadores, key words e similaridade. Identificadores únicos de sequências. Formato e interpretação de ficheiros GenBank (NCBI). Ficheiros de sequências em formato FASTA. Introdução ao BLAST como ferramenta de pesquisa por homologia. Princípio do algoritmo BLAST. BLAST vs. FASTa. Buscas de identidades em alinhamentos de nucleótidos e amino-ácidos: match, mismatch, gap, positivo. Família BLAST.
Introdução à algoritmia
9 outubro 2026, 14:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
Introdução à algoritmia com python: análise de sequências.
Introdução algoritmia
9 outubro 2026, 11:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
Introdução à algoritmia com python: análise de sequências.