Sumários

Casos práticos e exercícios sobre motivos

12 Dezembro 2025, 11:00 Dora Batista

Resolução de exercícios e questões práticas sobre a construção de matrizes de frequências, descoberta de motivos em alinhamentos de sequências, usando diferentes algorimos de pesquisa, como SMART e MEME, e representação de sequências consenso


Motivos – Sequências consenso

11 Dezembro 2025, 13:30 Dora Batista

Sequências consenso e formas de representação. O consenso pela maioria; A utilização do código IUPAC nas ambiguidades; O formato Prosite, A representação gráfica-Sequence Logos. A  entropia de Shanon e a representação da quantidade de informação. Sistemas de pesquisa e representação disponíveis na Web.


Motivos

10 Dezembro 2025, 14:30 Dora Batista

Conceito de motivo em sequências de DNA e de proteínas, e relação funcional. O exemplo dos factores de transcrição. A importância da descoberta de motivos e algoritmos de pesquisa. Conceitos e dificuldades. As matrizes de frequências e matrizes de substituição de posições específicas (PSSM) e sua aplicação: o caso do PSI-BLAST. Representação de padrões: As sequências consenso


Estatística | Resolução de exercícios (TP10)

5 Dezembro 2025, 13:30 Maria João Teixeira Martins

Resoluções de Exercícios à mão e com Python: Exerc. 3.1, 3.2 (máxima verosimilhança), 4.1 e 4.2 (bootstrap).


Estatística | Resolução de exercícios (TP09)

5 Dezembro 2025, 11:00 Maria João Teixeira Martins

Resoluções de Exercícios à mão e com Python: Exerc. 3.1, 3.2 (máxima verosimilhança), 4.1 e 4.2 (bootstrap).