Sumários

Estatística | Reamostragem Bootstrap

4 Dezembro 2025, 13:30 • Maria João Teixeira Martins

Máxima Verosimilhança (conclusão)

Propriedades (assintóticas para grandes amostras) dos estimadores de máxima verosimilhança. O princípio da máxima verosimilhança na estimação de árvores filogenéticas.


Método de reamostragem Bootstrap

Motivação. Ilustração de situações em que a inferência clássica não é aplicável (por falharem os pressupostos ou por desconhecimento da distribuição do estimador). 
Amostras bootstrap, estimativas bootstrap, a variância das estimativas bootstrap como estimativa da variância de um estimador. 
Intervalos de confiança bootstrap: método dos percentis e intervalo básico. 
O bootstrap na reconstrução de árvores filogenéticas.

Estatística | Método da máxima verosimilhança

3 Dezembro 2025, 14:30 • Maria João Teixeira Martins

Propriedades de um estimador: viés, variância e erro quadrático médio de um estimador. 
Definição de verosimilhança de uma amostra no caso de populações discretas e de populações contínuas. 
A log-verosimilhança. Exemplos de maximização da função log-verosimilhança.

Análise Filogenética – caso prático

28 Novembro 2025, 13:30 • Dora Batista

Reconstrução filogenética por máxima parcimónia. Preparação da matriz de dados: download das respectivas sequências do NCBI e organização dos dados. Alinhamento das sequências no BioEdit e construção da árvore no MEGA utilizando o método de máxima parcimónia com base em dados de um gene mitocondrial em vertebrados (família Mustelidae). Identificação de classes de caracteres no alinhamento e parâmetros de estimação da árvore: enraizamento, bootstrap, métodos de procura da melhor árvore e árvores consensus. Interpretação da árvore obtida – relações evolutivas entre espécies de mustelídeos.


Análise Filogenética – caso prático

28 Novembro 2025, 11:00 • Dora Batista

Reconstrução filogenética por máxima parcimónia. Preparação da matriz de dados: download das respectivas sequências do NCBI e organização dos dados. Alinhamento das sequências no BioEdit e construção da árvore no MEGA utilizando o método de máxima parcimónia com base em dados de um gene mitocondrial em vertebrados (família Mustelidae). Identificação de classes de caracteres no alinhamento e parâmetros de estimação da árvore: enraizamento, bootstrap, métodos de procura da melhor árvore e árvores consensus. Interpretação da árvore obtida – relações evolutivas entre espécies de mustelídeos.

Análise Filogenética

27 Novembro 2025, 13:30 • Dora Batista

Introdução à filogenética. Conceitos básicos. Tipos de caracteres, tipos de dados e tipos de árvores. Terminologia e conceitos cladísticos. Classificação e tipos de métodos de inferência filogenética. Principais métodos baseados em critério de optimalidade: maxima parcimónia, máxima verosimilhança e inferência bayesiana.