Disciplina Curricular
Biotecnologia Vegetal BiotecVeg
Mestrado Bolonha em Engenharia Agronómica - MEA 2016-2017
Contextos
Grupo: MEA 2016-2017 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Áreas de Especialização > Protecção de Plantas
Período:
Grupo: MEA 2016-2017 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Áreas de Especialização > Agro-Pecuária
Período:
Grupo: MEA 2016-2017 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Áreas de Especialização > Sem Área de Especialização
Período:
Grupo: MEA 2016-2017 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Áreas de Especialização > Engenharia Rural
Período:
Grupo: MEA 2016-2017 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Áreas de Especialização > Hortofruticultura e Viticultura
Período:
Peso
6.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Introdução ao tema “Biotecnologia Vegetal”;
Fornecer aos alunos elementos para compreenderem e aplicarem conhecimentos de Genómica de Eucariotas, Marcadores Moleculares e suas aplicações em Agricultura (selecção assistida, fitopatologia, rendimento e qualidade, etc;
Transmitir conhecimentos teóricos e práticos sobre Transferência de Genes e Expressão Génica; Regeneração de plantas por Cultura de Tecidos
Estimular o estudo independente e discussão dos temas
Programa
Teóricas – 2ª feira 11 h às 13 h Anfiteatro A3
Aulas nº 1, 2, 3 Luísa Carvalho
1. Cultura de Tecidos
3.1.Conceitos e aplicações
3.2. Bases experimentais do Laboratório de Cultura de Tecidos
3.2.1. Meios de cultura: composição, preparação e características
3.2.2 Condições físicas do desenvolvimento das culturas
3.3. Tipos de culturas
3.3.1. Culturas de estruturas pré-determinadas
3.3.2. Cultura de estruturas desdiferenciadas
3.3.3. Cultura de células em suspensão
3.4. Propagação de plantas por cultura in vitro
3.4.1. Micropropagação em meio sólido e em BIT (bioreatores de imersão temporária)
3.4.2. Organogénese por desenvolvimento adventício
3.4.3. Embriogénese somática
3.5. Isolamento, cultura e fusão de protoplastos
3.6. Variação somaclonal e identificação de resistências
3.7. Assegurar a sobrevivência de plantas provenientes de cultura de tecidos: aclimatização
3.7.1. Stresse de transferência
3.7.2. Métodos de aclimatização
Aulas nº 4, 5 Leonor Morais
2. Material genético
1.1. Organização
1.2. Métodos de estudo
1.3. Sequenciação de DNA: métodos clássicos e métodos de alto débito
1.4. Expressão génica
3. Regulação da expressão génica. O mecanismo de RNAi e suas aplicações em Biotecnologia
Aula nº 6 – Mariana Mota
4. Métodos de extração de ácidos nucleicos
5. Conceitos gerais de amplificação de DNA (PCR)
Aulas 7 e 8ª Cristina Oliveira
6. Marcadores moleculares
6. 1.Técnicas gerais para obtenção de marcadores. Descrição dos principais marcadores
6.2. Aplicações em agricultura
6.2.1. Identificação varietal
6.2.2. Diversidade fenética e filogenética
6.2.3. Diagnóstico de organismos patogénicos
6.2.4. Seleção assistida por marcadores
Aula nº 9 – 1º Teste Cristina Oliveira
Aula nº 10 Ana Ribeiro
7. Técnica do PCR quantitativo (qPCR) e aplicações
Aulas nº 11, 12 Luísa Brito
8. Clonagem de genes em bactérias
8.1 Etapas envolvidas numa estratégia de clonagem
8.2 Hospedeiros de clonagem
8.3 Vectores de clonagem
8.4 Métodos de transferência de genes em bactérias
8.5 Métodos de selecção e rastreio de recombinantes
Aulas nº 13, 14 Jorge Almeida
9. Métodos de transferência de genes e expressão génica
9.1. Em plantas
9.2. Deteção da expressão génica
9.3. Estudos de casos
3 turmas Práticas 4ª feira 14h 30 min às 17h e 30 min Lab 24, 5ª feira das 8h às 11 h Sala 24 e das 14h e 30m às 17 h 30 min Lab 14
Práticas
Aulas nº 1, 2, 3 - Luísa Carvalho (Relatório)
Preparação de um meio de cultura; Manipulação em condições asséticas; cultura in vitro de embriões de oliveira, germinação de sementes de tomate. Seguimento das culturas estabelecidas. Repicagem de manutenção de plantas micropropagadas de tomate. Repicagem para início de aclimatização.
Aulas nº 4, 5 - Leonor Morais (Bioinformática) - Relatório
Introdução à Bioinformática; Consulta de bases de dados.
Buscas de similaridade: O algoritmo BLAST e parâmetros para avaliar a qualidade dos alinhamentos.
Identificação de sequências semelhantes através do alinhamento múltiplos de sequências de nucleótidos ou de aminoácidos.
Aula nº 6, 7, 8 - Mariana Mota - Relatório
Extração; quantificação, desenho primers e PCR para marcadores e para deteção; géis e análise de resultados.
Aulas nº 9, 10 - Ana Ribeiro - Perguntas
qPCR e análise dos resultados
Aulas nº 11, 12 - Luísa Brito - Perguntas
Utilização do plasmídeo pUC18 na clonagem de um gene heterólogo em Escherichia coli. Avaliação dos resultados.
Aula nº 13 - Cristina Oliveira - 2º teste
Funcionamento da Unidade Curricular
As matérias podem ser apresentadas nas aulas teóricas, 2ª feira no Anfiteatro A3, ou nas aulas teórico-práticas de 4ª e 5ª feira Lab 24 e Lab 18.
Alguns temas têm uma abordagem experimental (Lab 24 e 18 e Bancada de Fluxo laminar; Lab Horticultura).
Os trabalhos laboratoriais são realizados por grupos formados na aula prática com um número máximo de 4 estudantes.
Qualquer alteração será indicada pela(o) respectiva(o) docente.
Certas aulas têm Relatório de Grupo a entregar na aula seguinte ou uma semana após o termo do período experimental.
As aulas práticas tem presença obrigatória para ser admitido a exame final (ver Avaliação).
Métodos de ensino e avaliação
A avaliação consiste na avaliação da parte prática (5 relatórios ou pequenos questionários) que correspondem 25% da nota final (5% cada um)
e dois testes que correspondem a 75% da nota final. Para passar os testes têm que ter nota mínima de 8 valores e média ≥ 9,5 valores.
O exame final corresponderá a 75% da nota final no caso dos alunos não passem nos testes ou optem por esta modalidade, para passar no exame a nota mínima é 9,5 valores. Não é possível melhoria dos testes, os alunos que quiserem melhoria da nota(s) terão que se apresentar a exame final.
A presença nas aulas práticas é obrigatória para ser admitido a exame final.
Os alunos deverão contactar por mail os professores para fazer a marcação das dúvidas com antecedência.
Professore(a)s:
Ana Isabel Faria Ribeiro DRAT (Genética), aribeiro@isa.ulisboa.pt
Cristina Oliveira, DCEB (Horticultura), crismoniz@isa.ulisboa.pt
Jorge Almeida, DRAT (Genética), jampalmeida@isa.ulisboa.pt
Leonor Morais, DRAT (Genética), lmorais@isa.ulisboa.pt
Luísa Brito, DRAT (Microbiologia), lbrito@isa.ulisboa.pt
Luísa Carvalho DRAT (Fisiologia), lcarvalho@isa.ulisboa.pt
Mariana Mota, DCEB (Horticultura), mariana@isa.ulisboa.pt