Sumários
Aula 12. Recapitulação da matéria leccionada
21 Dezembro 2023, 08:30 • Catarina Ginja
Recapitulação da matéria leccionada. GWAS, genética de populações, testes paternidade (discussão dos resultados dos exercícios).
Aula 11. Estudos de Associação genómica (GWAS) e modelo animal-BLUP
19 Dezembro 2023, 14:00 • Catarina Ginja
Estudos de Associação Genómica (GWAS): princípio, informação fenotípica, genótipos.
Exercício prático ex. ovelhas autóctones: Análise exploratória dos dados. Filtragem dos dados (qualidade, MAF, Imputação, etc.). Pressupostos e estrutura populacional. Modelo Animal-rrBLUP. Análise de resultados: Manhatan and QQ-Plots. Bases de dados: anotação dos genes (Ensembl), ontologia genética e interpretação funcional.
Ruralbit – Bases de dados e gestão da informação dos Livros Genealógicos. Manuel Silveira
Aula 10. Análises genómicas. Marcadores moleculares de alta densidade: single nucleotide polymorphisms, SNPs
14 Dezembro 2023, 08:30 • Catarina Ginja
Sequenciação genómica e marcadores moleculares de alta-densidade: SNPs. Técnicas e principios básicos: sequenciação de novo vs resequencing; composição dos adaptadores, paired-end resequencing; como funciona uma flow-cell. SNPs, tipos de polimorfismos, bases de dados públicas (NCBI, ENSEMBL, UCSC Genome Browser, etc.).
Aula 9. Acasalamento e Selecção. Consanguinidade e relações de parentesco.
7 Dezembro 2023, 08:30 • Catarina Ginja
Factores que alteram as frequências génicas e genotípicas: selecção. Evolução da frequência de um gene recessivo em
Aula 8. Genética de populações e Equilibrio Hardy-Weinberg (continuação)
30 Novembro 2023, 08:30 • Catarina Ginja
Genética de populações (continuação), diversidade genética e factores que a condicionam, frequências génicas e genotípicas, Equilibrio Hardy-Weinberg, estrutura populacional.