Sumários

Estatística: aula prática

6 Dezembro 2024, 14:00 • Maria João Teixeira Martins

Resoluções de Exercícios à mão e com R: Exerc. 3.2 (máxima verosimilhança), 4.1 e 4.2 (bootstrap).
Aula lecionada via zoom a pedido dos estudantes.

Estatística: aula prática

6 Dezembro 2024, 11:00 • Maria João Teixeira Martins

Resoluções de Exercícios à mão e com R: Exerc. 3.2 (máxima verosimilhança), 4.1 e 4.2 (bootstrap).

Estatística: Método de reamostragem Bootstrap

5 Dezembro 2024, 13:00 • Maria João Teixeira Martins

Máxima Verosimilhança (conclusão)

Propriedades (assintóticas para grandes amostras) dos estimadores de máxima verosimilhança. O princípio da máxima verosimilhança na estimação de árvores filogenéticas.


Método de reamostragem Bootstrap

Motivação. Ilustração de situações em que a inferência clássica não é aplicável (por falharem os pressupostos ou por desconhecimento da distribuição do estimador). 
Amostras bootstrap, estimativas bootstrap, a variância das estimativas bootstrap como estimativa da variância de um estimador. 
Intervalos de confiança bootstrap: método dos percentis e intervalo básico. 
Teste de hipótese bootstrap ao parâmetro de uma população.  Exemplos.
O bootstrap na reconstrução de árvores filogenéticas.

Estatística: O Método da máxima verosimilhança

2 Dezembro 2024, 15:45 • Maria João Teixeira Martins

Propriedades de um estimador: viés, variância e erro quadrático médio de um estimador. 
Definição de verosimilhança de uma amostra no caso de populações discretas e de populações contínuas. 
A log-verosimilhança. Exemplos de maximização da função log-verosimilhança. 
Utilização da função mle do package stats4 do R para otimização numérica.(slides 87 a 102)

Análise filogenética - caso prático

29 Novembro 2024, 14:00 • Dora Batista

Reconstrução filogenética por máxima parcimónia. Construção de árvores filogenéticas utilizando o método de máxima parcimónia com base na matriz preparada na aula anterior. Alinhamento das sequências no BioEdit e construção da árvore no MEGA com base em dados de um gene mitocondrial em vertebrados (família Mustelidae). Identificação de classes de caracteres no alinhamento e parâmetros de estimação da árvore: enraizamento, bootstrap, métodos de procura da melhor árvore e árvores consensus. Interpretação da árvore obtida – relações evolutivas entre espécies de mustelídeos.