Sumários

Alinhamentos múltiplos de sequências

25 Novembro 2024, 15:45 Maria Leonor Mota Morais Cecílio

Tipos de homologias moleculares

O que se pode obter com os alinhamentos múltiplos
Diversos métodos de alinhar múltiplas sequências: os algoritmos CLUSTAL, Kalign, Muscle
Cálculo de scores de alinhamentos múltiplos
Editores de alinhamentos


Clustering (aula 3 TP10)

22 Novembro 2024, 14:00 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Metodos hierárquico alglomerativo. Exercícios. Métodos de partição não hierárquicos: kmeans e PAM.


Clustering (aula3 TP09)

22 Novembro 2024, 11:00 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Metodos hierárquico alglomerativo. Exercícios. Métodos de partição não hierárquicos: kmeans e PAM.


Clustering (aula 2)

21 Novembro 2024, 13:00 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução ao Clustering. O método hierárquico aglomerativo. Os algoritmos UPGMA ( Unweighted  Pair-Group Method with Arithmetic mean) e o algoritmo NJ (Neighbour Joining). A função hclust no R. O método hierárquico divisivo no R - função diana do package cluster do R.


Clustering (aula 1)

18 Novembro 2024, 15:45 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução ao Clustering. Cálculo da distância entre observações. O método hierárquico aglomerativo.