Sumários
Estatística: Testes Múltiplos
12 Outubro 2023, 14:30 • Maria João Teixeira Martins
Esclarecimento de dúvidas sobre as aulas anteriores. Conclusão da resolução do Exercício 1.1 (slide 56 de A Estatística do BLAST).
O problema dos testes de hipóteses múltiplos. Testes múltiplos a proporções. Simulações no R.
(Slides 62 a 70 de Testes Múltiplos)Estatística: A Estatística do BLAST (continuação) (TP10)
11 Outubro 2023, 11:45 • Maria João Teixeira Martins
O
E-value como medida da significância do alinhamento. Relação com o p-value do
teste. Seleção do sistema ótimo de pontuação com base nas target frequencies e na percentagem de identidades.
Bit-score. Relação entre bit-score e E-value e entre bit-score e dimensão da
base de dados. Resolução do Exercício 1.1: alíneas 1 a 4.
(Slides 34 a 55 de A Estatística do BLAST)
Estatística: A Estatística do BLAST (continuação) (TP09)
11 Outubro 2023, 09:15 • Maria João Teixeira Martins
O
E-value como medida da significância do alinhamento. Relação com o p-value do
teste. Seleção do sistema ótimo de pontuação com base nas target frequencies e na percentagem de identidades.
Bit-score. Relação entre bit-score e E-value e entre bit-score e dimensão da
base de dados. Resolução do Exercício 1.1: alíneas 1 a 4.
(Slides 34 a 55 de A Estatística do BLAST)
Estatística: A Estatística do BLAST
9 Outubro 2023, 08:15 • Maria João Teixeira Martins
Revisões de Testes de Hipóteses. Teste a uma proporção como exemplo.
A
Estatística do alinhamento de sequências no BLAST. Sistemas de pontuação,
alinhamento de mais alta pontuação (High Scoring Segment Pairs, HSP), teste de
hipóteses no alinhamento de sequências, teoria estatística de Karlin e Altschul
(1990) para alinhamentos locais sem gaps.
Distribuição assintótica (sequências longas) da pontuação (score) de alinhamentos HSP.
(Slides 1 a 33 de A Estatística do BLAST)
Introdução à algoritmia
4 Outubro 2023, 11:45 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
Introdução à algoritmia com R. Exemplos. Alinhamento global de sequências de dna. Resolução do exercício 6.