Sumários

Algoritmia

25 Setembro 2023, 08:15 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução à algoritmia com R. Objectos de class vector.

BLAST (Continuação)

21 Setembro 2023, 14:30 • Maria Leonor Mota Morais Cecílio

Matrizes de substituição para alinhamentos proteicos.

Parâmetros de avaliação da qualidade do alinhamento: raw score, bit score e e-value.

Interpretação dos resultados de BLAST.

A família BLAST.

Vários exemplos com resolução de exercícios em grupo

Bases de dados e introdução ao BLAST

20 Setembro 2023, 11:45 • Dora Batista

Estratégias de pesquisa de bases de dados: identificadores, key words e similaridade. Ficheiros FASTA de sequências. Resolução de exercícios em grupo e discussão de resultados.

Introdução ao BLAST como ferramenta de pesquisa. Princípio do algoritmo BLAST. BLAST vs. FASTa. Buscas de identidades em alinhamentos de nucleótidos e amino-ácidos: match, mismatch, gap, positivo

Bases de dados e introdução ao BLAST

20 Setembro 2023, 09:15 • Dora Batista

Estratégias de pesquisa de bases de dados: identificadores, key words e similaridade. Ficheiros FASTA de sequências. Resolução de exercícios em grupo e discussão de resultados.

Bases de dados de interesse biológico: tipos, conteúdo e acesso. Pesquisa no Entrez e interação entre bases de dados. NCBI, EMBL e Swiss-Prot: casos de estudo. Formato e interpretação de ficheiros GenBank (NCBI). Resolução de exercícios