Sumários
Análise filogenética II
26 Abril 2023, 14:30 • Dora Batista
Construção de árvores filogenéticas utilizando
o método de máxima parcimónia com base na matriz preparada na aula anterior.
Alinhamento das sequências no BioEdit e no MEGA. Estimação e interpretação da
árvore obtida: enraizamento, bootstrap, métodos de procura da melhor árvore e
árvores consensus. Comparação de árvores filogenéticas inferidas com base em
dados de um gene mitocondrial e nuclear em vertebrados.
Análise filogenética I
24 Abril 2023, 17:00 • Dora Batista
Introdução à
filogenética. Conceitos básicos. Tipos de caracteres, tipos de dados e tipos de
árvores. Terminologia e conceitos cladísticos. Classificação e tipos de métodos
de inferência filogenética. Principais métodos: UPGMA, Neigbour-Joining,
maxima parcimónia, máxima verosimilhança e inferência bayesiana.
Análise filogenética I
24 Abril 2023, 14:15 • Dora Batista
Introdução à
filogenética. Conceitos básicos. Tipos de caracteres, tipos de dados e tipos de
árvores. Terminologia e conceitos cladísticos. Classificação e tipos de métodos
de inferência filogenética. Principais métodos: UPGMA, Neigbour-Joining,
maxima parcimónia, máxima verosimilhança e inferência bayesiana.
Preparação de uma matriz de dados para a construção de uma
árvore filogenética: download das respectivas sequências do NCBI e organização
dos dados
Clustering
19 Abril 2023, 17:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
O algoritmo Neighbor Joining para árvores filogenéticas sem raiz. Algoritmos não hierárquicos de partição: kmeans e pam. Análise da qualidade das soluções.
Clustering
19 Abril 2023, 14:30 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira
O algoritmo Neighbor Joining para árvores filogenéticas sem raiz. Algoritmos não hierárquicos de partição: kmeans e pam. Análise da qualidade das soluções.