Sumários

Clustering

17 Abril 2023, 17:00 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução aos algoritmos de clustering. Cálculo de distâncias entre observações. Método hierárquico aglomerativo. Cálculo da distância entre classes. Exemplos. As funções dist e hclust no R.


Clustering

17 Abril 2023, 14:15 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução aos algoritmos de clustering. Cálculo de distâncias entre observações. Método hierárquico aglomerativo. Cálculo da distância entre classes. Exemplos. As funções dist e hclust no R.


Alinhamentos múltiplos de sequências

12 Abril 2023, 17:00 Dora Batista

Alinhamento múltiplos de sequências de proteínas vs DNA. Sistemas de pontuação. Custos de penalização de gaps. Métodos de alinhamento. Exercicios de alinhamento com Clustal Omega, Clustal W e MUSCLE


Alinhamentos múltiplos de sequências

12 Abril 2023, 14:30 Dora Batista

Alinhamento múltiplos de sequências de proteínas vs DNA. Sistemas de pontuação. Custos de penalização de gaps. Métodos de alinhamento. Exercicios de alinhamento com Clustal Omega, Clustal W e MUSCLE


Alinhamento de pares de sequências

3 Abril 2023, 17:00 Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Alinhamento de pares de sequências. Algoritmos exatos e algoritmos heurísticos. O Blast. Algoritmo exato de alinhamento global de Needlman-Wunsch (1970) e o algoritmo exato de alinhamento local de Smith-Waterman (1981).