Sumários

Introdução à algoritmia com R

6 Março 2023, 17:00 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução ao R e RStudio. Objectos de class vector e class data.frame. Contagem do número de adeninas, tiaminas, citosinas e guaninas numa sequência de dna.

Introdução à Algoritmia com R

6 Março 2023, 14:15 • Marta Guerreiro Duarte Mesquita de Oliveira

Introdução ao R e RStudio. Objectos de class vector e class data.frame. Cntagem do número de adeninas, tiaminas, citosinas e guaninas numa sequência de dna.

Bases de dados de interesse biológico: tipos, conteúdo e acesso. Pesquisa no Entrez e interação entre bases de dados. NCBI, EMBL e Swiss-Prot: casos de estudo. Formatos e interpretação de ficheiros GenBank (NCBI). Estratégias de pesquisa de bases de dados: identificadores, key words e similaridade. Resolução de exercícios em grupo e discussão de resultados.

Bases de dados

1 Março 2023, 14:30 • Dora Batista

Análise de dados de sequenciação

27 Fevereiro 2023, 17:00 • Dora Batista

Outputs de sequenciação automática sanger: tipos de ficheiros, cromatogramas e quality scores. Interpretação de cromatogramas e problemas comuns. Inspeção manual dos cromatogramas. Análise de sequências no Bioedit: edição, assembly do forward e reverse e produção da sequência consensus em formato fasta. Trabalho de grupo.